174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0919 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1209  glycyl-tRNA synthetase  71.76 
 
 		 607 aa  900    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1707  glycyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 572 aa  638    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0919  glycyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 581 aa  1195    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0271  glycyl-tRNA synthetase  61.45 
 
 		 577 aa  751    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.411942  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1156  glycyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 576 aa  652    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0814  glycyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 		 573 aa  635    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1061  glycyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 573 aa  620  1e-176  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.238733  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1227  glycyl-tRNA synthetase  51.46 
 
 		 574 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1419  glycyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 		 576 aa  605  9.999999999999999e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1294  glycyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 579 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1214  glycyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 574 aa  596  1e-169  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.721399  normal  0.84137 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0741  glycyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 574 aa  597  1e-169  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483491  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1458  glycyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 575 aa  587  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1488  glycyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 586 aa  556  1e-157  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0293  glycyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 594 aa  523  1e-147  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0367979  normal  0.30338 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0796  glycyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 589 aa  521  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3710  glycyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 593 aa  505  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1989  glycyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 630 aa  508  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101763  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0734  glycyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 557 aa  483  1e-135  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0237887  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12730  predicted protein  40.63 
 
 		 677 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.384524 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0336  glycyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 590 aa  442  1e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1420  glycyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 574 aa  434  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11125  glycyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_5G05920)  39.25 
 
 		 689 aa  425  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1628  glycyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 588 aa  425  1e-117  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1433  glycyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 583 aa  420  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1821  glycyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 585 aa  416  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2213  glycyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 571 aa  416  9.999999999999999e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.472902  hitchhiker  0.00000523773 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19761  predicted protein  38.37 
 
 		 702 aa  416  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0895  glycyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 585 aa  412  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00730  glycine-tRNA ligase, putative  35.93 
 
 		 699 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64855  cyl-tRNA synthase  37.84 
 
 		 661 aa  407  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0270271 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50885  predicted protein  33.06 
 
 		 602 aa  281  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0288  glycyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 497 aa  276  7e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0063  glycyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 485 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.823142 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1654  glycyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 551 aa  267  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0933  glycyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4697  glycyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 459 aa  257  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1716  glycyl-tRNA synthetase  31.76 
 
 		 504 aa  256  8e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.391991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0862  glycyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 		 530 aa  247  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1451  glycyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 539 aa  246  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.269775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0046  glycyl-tRNA synthetase  30.19 
 
 		 530 aa  243  9e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1861  glycyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 		 508 aa  239  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.201477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1581  glycyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 464 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1348  glycyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 462 aa  234  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000102075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1312  glycyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 462 aa  233  8.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00852036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2779  glycyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 467 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2465  glycyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 467 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1263  glycyl-tRNA synthetase  31.79 
 
 		 448 aa  231  3e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.632012  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3372  glycyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 460 aa  228  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000503575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3494  glycyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 460 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1789  glycyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 		 462 aa  224  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.143948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3524  glycyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 458 aa  224  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0648  glycyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 462 aa  224  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4736  glycyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 458 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.16932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5053  glycyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4784  glycyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.926667  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4646  glycyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5147  glycyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5025  glycyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1410  glycyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 434 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000029424  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5058  glycyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 458 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5268  glycyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0505  glycyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 		 456 aa  221  3e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0275239  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5046  glycyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 458 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0188  glycyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 458 aa  220  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0713  glycyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 		 443 aa  219  7e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4624  glycyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 458 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.27496  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_693  glycyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 		 445 aa  219  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.538165  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0787  glycyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 		 433 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.554245  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1841  glycyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 457 aa  217  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1776  glycyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 462 aa  217  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0539153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0775  glycyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 466 aa  216  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1926  glycyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 460 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0030323  hitchhiker  0.00269107 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13710  glycyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 		 462 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.797043  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl268  glycyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 451 aa  213  7e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000087846  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1667  glycyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 467 aa  213  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0149928  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3445  glycyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578454  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13710  glycyl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 463 aa  212  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3508  glycyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3456  glycyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 468 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.740599  normal  0.258272 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2167  glycyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 466 aa  211  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0746701  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0020  glycyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 451 aa  209  8e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.485977  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2182  glycyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 462 aa  209  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.151014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1182  glycyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 461 aa  209  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0740  glycyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 		 462 aa  207  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3818  glycyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 468 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196425  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7032  glycyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 460 aa  207  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.761562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2477  glycyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 481 aa  207  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0373  glycyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 		 445 aa  206  7e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1132  glycyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 		 463 aa  205  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.404381  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1367  glycyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 461 aa  205  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000023951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1940  glycyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0293007  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2719  glycyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 467 aa  205  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0770319  normal  0.583311 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1623  glycyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 		 463 aa  205  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1657  glycyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 		 463 aa  205  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17070  glycyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 		 463 aa  204  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0010588  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0454  glycine--tRNA ligase  34.67 
 
 		 506 aa  204  3e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0861  glycyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 462 aa  204  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.651582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2346  anticodon binding domain protein  34.59 
 
 		 461 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1266  glycyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>