52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1431 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  100 
 
 
326 aa  648    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0595  hypothetical protein  47.97 
 
 
196 aa  97.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0522  hypothetical protein  41.67 
 
 
941 aa  96.7  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.057808  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1197  PEGA domain-containing protein  31.2 
 
 
364 aa  92.8  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.258799  hitchhiker  0.00873035 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2413  hypothetical protein  44.95 
 
 
909 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.273323  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0550  hypothetical protein  46.15 
 
 
773 aa  90.1  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.00000581827  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  31.82 
 
 
432 aa  88.6  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  33.33 
 
 
684 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2495  PEGA  33.69 
 
 
436 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.441491  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1891  PEGA domain protein  32.7 
 
 
460 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  30.8 
 
 
561 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2513  hypothetical protein  40.35 
 
 
847 aa  80.5  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2263  hypothetical protein  39.47 
 
 
862 aa  79.7  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.716746  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2148  hypothetical protein  35.57 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43566  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0134  hypothetical protein  30.43 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2759  hypothetical protein  42.45 
 
 
892 aa  72.8  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.257016  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  34.94 
 
 
435 aa  72.8  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  32.09 
 
 
600 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  32.37 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  33.12 
 
 
497 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  35.61 
 
 
409 aa  69.3  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  35.38 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  36 
 
 
1096 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  29.33 
 
 
613 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  34.06 
 
 
963 aa  66.6  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  30.1 
 
 
546 aa  66.2  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3597  PEGA domain protein  28.83 
 
 
727 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.956327  normal  0.0137452 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  31.73 
 
 
456 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  30.77 
 
 
456 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0335  PEGA domain-containing protein  45.9 
 
 
226 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.250478  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03503  Secreted protein with uncharacterized domain  25.7 
 
 
660 aa  54.3  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0772  hypothetical protein  26.38 
 
 
335 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133586  normal  0.240825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1818  PEGA domain protein  29.45 
 
 
592 aa  52.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1453  PEGA domain-containing protein  37.7 
 
 
276 aa  50.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0637995  normal  0.0741839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2682  serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 
752 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0065  hypothetical protein  30.28 
 
 
754 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000275591  decreased coverage  0.0000022772 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2302  hypothetical protein  29.23 
 
 
271 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2300  PEGA  27.65 
 
 
311 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2480  hypothetical protein  28.72 
 
 
364 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2665  PEGA domain-containing protein  37.88 
 
 
267 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2317  PEGA domain-containing protein  31.58 
 
 
379 aa  46.2  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  28.79 
 
 
930 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2498  PKD  23.08 
 
 
465 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000170724  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0016  hypothetical protein  26.23 
 
 
553 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.697123  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6069  serine/threonine protein kinase  25.81 
 
 
883 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.249912  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0483  PEGA  36.21 
 
 
118 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  43.1 
 
 
750 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  38.1 
 
 
300 aa  43.5  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3881  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 
593 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.154001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3797  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 
593 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.059724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0262  serine/threonine protein kinase  25.74 
 
 
806 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297751  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0847  hypothetical protein  41.18 
 
 
134 aa  42.7  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.104899  normal  0.523953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>