69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0075 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0075  peptidase M50  100 
 
 
212 aa  417  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.211405  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1987  peptidase M50  52.13 
 
 
198 aa  187  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.345165 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0156  peptidase M50  52.4 
 
 
207 aa  179  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2536  peptidase M50  50.24 
 
 
208 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0055  hypothetical protein  41.74 
 
 
230 aa  160  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0133021 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2747  peptidase M50  43.84 
 
 
213 aa  138  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0435  peptidase M50  40.28 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3494  peptidase M50  37.91 
 
 
209 aa  115  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.698821  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1624  peptidase M50  40.67 
 
 
212 aa  112  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1924  peptidase M50  34.54 
 
 
214 aa  107  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.434385  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0765  peptidase M50  39.81 
 
 
200 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.249654  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0861  peptidase M50  37.82 
 
 
222 aa  105  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1021  peptidase M50  39.18 
 
 
196 aa  102  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0058  peptidase M50  38.22 
 
 
200 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643097  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1153  peptidase M50  40.35 
 
 
200 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.41947  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0830  peptidase M50  40.25 
 
 
199 aa  99.8  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0470  peptidase M50  38.65 
 
 
201 aa  97.4  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0990  peptidase M50  33.84 
 
 
224 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1308  peptidase M50  38.69 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141861  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0242  peptidase M50  40.82 
 
 
201 aa  84.7  9e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.989746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3812  peptidase M50  33.68 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0317  peptidase M50  37.28 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0775  peptidase M50  36 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0928  peptidase M50  33.33 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.882812 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2169  peptidase M50  34.18 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000408373 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0909  peptidase M50  32.8 
 
 
184 aa  63.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.470525  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1442  peptidase M50  29.31 
 
 
201 aa  61.6  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.535912  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0691  peptidase M50  31.41 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00130095 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2208  hypothetical protein  32.26 
 
 
205 aa  52.4  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3608  M50 family peptidase  28.82 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1202  peptidase M50  31.79 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1748  peptidase M50  27.06 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.658788  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0984  peptidase M50  31.97 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0881393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0550  peptidase M50  27.54 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1102  peptidase M50  35.71 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  27.88 
 
 
364 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2088  peptidase M50  30.13 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.56108 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1881  peptidase M50  29.45 
 
 
225 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000148344  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1456  peptidase M50  27.11 
 
 
218 aa  45.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1132  peptidase M50  28.87 
 
 
207 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.262722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3464  peptidase M50  29.09 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0033  peptidase M50  30.51 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2335  peptidase M50  27.27 
 
 
224 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1080  peptidase M50  31.29 
 
 
221 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146579  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2016  peptidase M50  27.56 
 
 
227 aa  45.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0347485  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1132  peptidase M50  27.59 
 
 
246 aa  45.1  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2826  peptidase M50  28.05 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1066  peptidase M50  30.07 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.128232  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5499  peptidase, M50 family  30.52 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5451  peptidase, M50 family  30.52 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1301  peptidase M50  34.27 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3437  peptidase M50  27.7 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.418421 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  29.48 
 
 
375 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2770  peptidase M50  27.7 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  26.92 
 
 
379 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5225  hypothetical protein  29.53 
 
 
224 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5469  peptidase, M50 family  29.53 
 
 
224 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5555  peptidase, M50 family  29.53 
 
 
224 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1229  peptidase M50  27.54 
 
 
222 aa  42.7  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5625  hypothetical protein  29.53 
 
 
224 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2251  peptidase M50  27.22 
 
 
226 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5073  membrane protein; metalloprotease  29.53 
 
 
224 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5058  membrane protein; metalloprotease  29.53 
 
 
224 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5170  peptidase M50  30.52 
 
 
224 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3065  peptidase M50  28.57 
 
 
237 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00942049  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1231  peptidase M50  25.95 
 
 
216 aa  42  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0685  peptidase M50  27.17 
 
 
223 aa  42  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1326  peptidase M50  28.81 
 
 
225 aa  41.6  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38165  normal  0.352309 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  24.84 
 
 
380 aa  41.6  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>