More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0054 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  100 
 
 		 528 aa  1088    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  53.18 
 
 		 531 aa  519  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  55.24 
 
 		 316 aa  355  1e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0825  glycosyl transferase family 2  53.58 
 
 		 351 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531655  normal  0.237079 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3161  glycosyl transferase family protein  51.94 
 
 		 316 aa  333  5e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.23698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2495  glycosyl transferase family 2  45.71 
 
 		 343 aa  314  2.9999999999999996e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3273  glycosyl transferase family 2  43.22 
 
 		 365 aa  298  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1129  glycosyl transferase family 2  44.89 
 
 		 351 aa  297  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2018  glycosyl transferase family protein  40.64 
 
 		 391 aa  276  5e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5183  glycosyl transferase family 2  40.9 
 
 		 352 aa  257  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3753  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  43.22 
 
 		 311 aa  256  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0868  ribonuclease BN  42.36 
 
 		 318 aa  255  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0535  glycosyl transferase family protein  43.04 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3015  glycosyl transferase family 2  41.31 
 
 		 458 aa  246  6.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0196  glycosyl transferase family protein  44.85 
 
 		 298 aa  236  6e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000720605  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2041  glycosyl transferase family 2  44.66 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0480  glycosyl transferase family 2  40.56 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5070  glycosyl transferase family 2  41.1 
 
 		 257 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4065  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 		 338 aa  167  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2417  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 		 346 aa  166  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0634  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 332 aa  163  9e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.289574 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3501  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.137120000000001e-33 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2020  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  54.69 
 
 		 153 aa  151  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5930  glycosyl transferase family protein  32.57 
 
 		 319 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 		 362 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 		 355 aa  117  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4051  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 		 251 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 253 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 313 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 		 226 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 253 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 		 227 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 		 321 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1323  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 		 247 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000286825  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2509  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.17 
 
 		 254 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1105  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 245 aa  100  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000104847  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 		 301 aa  100  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0033  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.87 
 
 		 247 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0326174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  28.77 
 
 		 299 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2243  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 264 aa  98.6  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 		 448 aa  97.4  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 		 227 aa  96.7  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  30.04 
 
 		 247 aa  96.3  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0121  b-glycosyltransferase  31.02 
 
 		 250 aa  95.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 293 aa  94.4  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  33.33 
 
 		 321 aa  93.2  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 344 aa  93.2  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1622  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 		 280 aa  93.2  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.429819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 242 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 340 aa  91.7  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 		 229 aa  91.7  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0534  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 238 aa  91.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 		 393 aa  91.3  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 		 243 aa  90.9  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 		 354 aa  90.5  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 		 230 aa  89.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 		 319 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 242 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 242 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 		 229 aa  88.6  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  31.5 
 
 		 352 aa  87.8  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  32.96 
 
 		 287 aa  88.2  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 		 230 aa  87.8  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  29.39 
 
 		 328 aa  87.4  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6508  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 		 246 aa  87  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000357167  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 298 aa  86.7  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1421  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.73 
 
 		 243 aa  86.3  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000839573  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  27.31 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  27.18 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5753  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 		 246 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 229 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 		 228 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 		 236 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 220 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  27.74 
 
 		 319 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 230 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.77 
 
 		 238 aa  79.7  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 307 aa  79.7  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 		 237 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 		 340 aa  79.3  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3003  b-glycosyltransferase  30.9 
 
 		 240 aa  78.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00616181  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0213  glycosyltransferase  30.86 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.46 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 		 246 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>