35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02436 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02436  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  412  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1726  hypothetical protein  56.63 
 
 		 198 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3480  hypothetical protein  40.93 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0695  hypothetical protein  36.61 
 
 		 189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1475  hypothetical protein  34.05 
 
 		 191 aa  120  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01529  hypothetical protein  34.97 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003993  hypothetical protein  34.59 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.945378  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1811  hypothetical protein  31 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0129545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2288  hypothetical protein  29.5 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1731  hypothetical protein  30.65 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000442595  normal  0.728518 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1812  hypothetical protein  31.22 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.028303  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1631  hypothetical protein  33.71 
 
 		 193 aa  98.6  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000294763  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1544  hypothetical protein  28.96 
 
 		 194 aa  98.2  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00234797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2256  hypothetical protein  29.02 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2157  hypothetical protein  29.26 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311546  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2832  hypothetical protein  30.57 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000632951  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1331  hypothetical protein  28.42 
 
 		 193 aa  91.3  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.921495  normal  0.485409 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2394  hypothetical protein  27.65 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000175566  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2398  hypothetical protein  30.85 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249611  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2510  hypothetical protein  27.23 
 
 		 219 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0427588  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2405  hypothetical protein  27.19 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00249071  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1953  hypothetical protein  26.73 
 
 		 223 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38277  normal  0.0743494 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1675  hypothetical protein  26.61 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3860  hypothetical protein  25.25 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25420  hypothetical protein  29.28 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2172  hypothetical protein  27.62 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2108  hypothetical protein  25.99 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1903  hypothetical protein  26.06 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378219  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1694  type IV pilus assembly PilZ  25.68 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3589  type IV pilus assembly PilZ  25.14 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.549929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2153  type IV pilus assembly PilZ  25.68 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1670  type IV pilus assembly PilZ  24.58 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1808  hypothetical protein  27.64 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1606  type IV pilus assembly PilZ  24.58 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.0962013 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1844  type IV pilus assembly PilZ  23.98 
 
 		 193 aa  44.7  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.177632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>