22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1475 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1475  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  388  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01529  hypothetical protein  64.36 
 
 		 196 aa  248  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003993  hypothetical protein  63.3 
 
 		 189 aa  245  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.945378  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0695  hypothetical protein  53.23 
 
 		 189 aa  177  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02436  hypothetical protein  34.05 
 
 		 199 aa  120  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1726  hypothetical protein  36.46 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3480  hypothetical protein  27.68 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1544  hypothetical protein  27.89 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00234797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2256  hypothetical protein  28.22 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1811  hypothetical protein  27.23 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0129545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2832  hypothetical protein  23.35 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000632951  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1731  hypothetical protein  26.87 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000442595  normal  0.728518 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2288  hypothetical protein  26.73 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2157  hypothetical protein  25.38 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311546  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1812  hypothetical protein  23.56 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.028303  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1631  hypothetical protein  24.16 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000294763  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1331  hypothetical protein  23.33 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.921495  normal  0.485409 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2405  hypothetical protein  23.39 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00249071  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2510  hypothetical protein  22.9 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0427588  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1953  hypothetical protein  22.02 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38277  normal  0.0743494 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2394  hypothetical protein  22.02 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000175566  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2398  hypothetical protein  21.13 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>