23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1331 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1331  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.921495  normal  0.485409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2832  hypothetical protein  51.74 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000632951  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2288  hypothetical protein  53.5 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1811  hypothetical protein  52.5 
 
 		 206 aa  195  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0129545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1731  hypothetical protein  52.76 
 
 		 205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000442595  normal  0.728518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2157  hypothetical protein  53.09 
 
 		 201 aa  193  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311546  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2256  hypothetical protein  52.76 
 
 		 206 aa  191  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2394  hypothetical protein  46.3 
 
 		 223 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000175566  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1812  hypothetical protein  51.31 
 
 		 197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.028303  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2510  hypothetical protein  47.17 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0427588  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1953  hypothetical protein  46.3 
 
 		 223 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38277  normal  0.0743494 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2405  hypothetical protein  46.3 
 
 		 223 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00249071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2398  hypothetical protein  54.17 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249611  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1544  hypothetical protein  48.69 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00234797  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1631  hypothetical protein  51.16 
 
 		 193 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000294763  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1675  hypothetical protein  49.3 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220526  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02436  hypothetical protein  28.42 
 
 		 199 aa  91.3  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1726  hypothetical protein  27.72 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3480  hypothetical protein  27.51 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01529  hypothetical protein  24.58 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0695  hypothetical protein  28.34 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1475  hypothetical protein  23.33 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003993  hypothetical protein  24.02 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.945378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>