24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0695 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0695  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  390  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1475  hypothetical protein  53.23 
 
 
191 aa  194  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003993  hypothetical protein  52.41 
 
 
189 aa  190  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.945378  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01529  hypothetical protein  50.54 
 
 
196 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02436  hypothetical protein  36.61 
 
 
199 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1726  hypothetical protein  32.24 
 
 
198 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3480  hypothetical protein  31.02 
 
 
200 aa  96.3  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1544  hypothetical protein  26.84 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00234797  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1631  hypothetical protein  28.07 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000294763  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1811  hypothetical protein  26.63 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0129545  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2288  hypothetical protein  26.13 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1731  hypothetical protein  26.26 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000442595  normal  0.728518 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2256  hypothetical protein  27.14 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1331  hypothetical protein  28.34 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.921495  normal  0.485409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2832  hypothetical protein  24.47 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000632951  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1812  hypothetical protein  24.61 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.028303  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2157  hypothetical protein  26.13 
 
 
201 aa  62  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311546  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2398  hypothetical protein  25.79 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249611  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2405  hypothetical protein  23.79 
 
 
223 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00249071  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1675  hypothetical protein  24.77 
 
 
222 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2394  hypothetical protein  22.69 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000175566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1953  hypothetical protein  23.35 
 
 
223 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38277  normal  0.0743494 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2510  hypothetical protein  24.22 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0427588  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3860  hypothetical protein  23.71 
 
 
193 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>