25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2256 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2256  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  417  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1811  hypothetical protein  89.32 
 
 		 206 aa  370  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0129545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2288  hypothetical protein  89.32 
 
 		 206 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1731  hypothetical protein  89.32 
 
 		 205 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000442595  normal  0.728518 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2157  hypothetical protein  76.21 
 
 		 201 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311546  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2405  hypothetical protein  72.65 
 
 		 223 aa  313  9e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00249071  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2394  hypothetical protein  72.2 
 
 		 223 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000175566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2510  hypothetical protein  73.06 
 
 		 219 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0427588  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1953  hypothetical protein  69.96 
 
 		 223 aa  310  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38277  normal  0.0743494 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2832  hypothetical protein  56.93 
 
 		 201 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000632951  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1812  hypothetical protein  56.93 
 
 		 197 aa  229  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.028303  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2398  hypothetical protein  57.69 
 
 		 199 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249611  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1675  hypothetical protein  59.63 
 
 		 222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1544  hypothetical protein  55.45 
 
 		 194 aa  214  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00234797  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1631  hypothetical protein  53.68 
 
 		 193 aa  194  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000294763  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1331  hypothetical protein  52.76 
 
 		 193 aa  191  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.921495  normal  0.485409 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02436  hypothetical protein  29.02 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1726  hypothetical protein  29.02 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003993  hypothetical protein  27.36 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.945378  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01529  hypothetical protein  27.86 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1475  hypothetical protein  28.22 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3480  hypothetical protein  26.4 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0695  hypothetical protein  27.14 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3860  hypothetical protein  26.38 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1606  type IV pilus assembly PilZ  24.07 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.0962013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>