23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1953 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1953  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38277  normal  0.0743494 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2394  hypothetical protein  98.21 
 
 
223 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000175566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2510  hypothetical protein  96.41 
 
 
219 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0427588  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2405  hypothetical protein  94.17 
 
 
223 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00249071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1731  hypothetical protein  72.65 
 
 
205 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000442595  normal  0.728518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1811  hypothetical protein  71.75 
 
 
206 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0129545  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2256  hypothetical protein  69.96 
 
 
206 aa  310  9e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2157  hypothetical protein  70.4 
 
 
201 aa  308  5e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311546  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2288  hypothetical protein  71.3 
 
 
206 aa  308  5e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2832  hypothetical protein  53.42 
 
 
201 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000632951  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1812  hypothetical protein  51.6 
 
 
197 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.028303  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1675  hypothetical protein  55.75 
 
 
222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220526  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2398  hypothetical protein  52.78 
 
 
199 aa  207  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249611  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1544  hypothetical protein  48.4 
 
 
194 aa  207  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00234797  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1631  hypothetical protein  50.72 
 
 
193 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000294763  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1331  hypothetical protein  46.3 
 
 
193 aa  181  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.921495  normal  0.485409 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02436  hypothetical protein  26.73 
 
 
199 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1726  hypothetical protein  24.29 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3480  hypothetical protein  26.03 
 
 
200 aa  58.9  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1475  hypothetical protein  22.02 
 
 
191 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003993  hypothetical protein  22.94 
 
 
189 aa  48.5  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.945378  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01529  hypothetical protein  22.02 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0695  hypothetical protein  22.69 
 
 
189 aa  41.6  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>