285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0680 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0680  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
186 aa  377  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1103  putative phosphinothricin acetyltransferase  69.83 
 
 
190 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1401  GCN5-related N-acetyltransferase  62.57 
 
 
174 aa  223  9e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  58.99 
 
 
181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1689  GCN5-related N-acetyltransferase  57.56 
 
 
178 aa  210  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1460  GCN5-related N-acetyltransferase  57.56 
 
 
178 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1883  GCN5-related N-acetyltransferase  58.24 
 
 
197 aa  208  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.278862  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5346  GCN5-related N-acetyltransferase  59.06 
 
 
174 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  58.86 
 
 
205 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104009  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3356  GCN5-related N-acetyltransferase  57.31 
 
 
173 aa  202  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  57.31 
 
 
173 aa  202  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0528  GCN5-related N-acetyltransferase  54.29 
 
 
181 aa  194  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  54.39 
 
 
180 aa  191  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  53.14 
 
 
176 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695211  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1472  Phosphinothricin acetyltransferase  56.65 
 
 
174 aa  187  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1342  GCN5-related N-acetyltransferase  53.55 
 
 
185 aa  186  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327917  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0201  GCN5-related N-acetyltransferase  55.17 
 
 
174 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0385  phosphinothricin acetyltransferase (PPT N-acetyltransferase)  52.3 
 
 
176 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0238  GCN5-related N-acetyltransferase  53.45 
 
 
183 aa  178  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3735  GCN5-related N-acetyltransferase  51.45 
 
 
185 aa  177  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3321  phosphinothricin N-acetyltransferase  48.85 
 
 
179 aa  177  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0173112  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4184  acetyltransferase  51.16 
 
 
209 aa  176  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0397  phosphinothricin acetyltransferase protein  52.73 
 
 
183 aa  175  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456114  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2931  Phosphinothricin acetyltransferase  50 
 
 
178 aa  175  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4058  GCN5-related N-acetyltransferase  50.87 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6053  GCN5-related N-acetyltransferase  50.87 
 
 
180 aa  170  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134247  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7237  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
182 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.354809  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  50.59 
 
 
186 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  50.59 
 
 
185 aa  168  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3647  GCN5-related N-acetyltransferase  52.47 
 
 
182 aa  167  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3155  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
179 aa  167  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145568  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  52.47 
 
 
182 aa  167  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0556271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  49.13 
 
 
184 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3437  GCN5-related N-acetyltransferase  47.13 
 
 
206 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3435  GCN5-related N-acetyltransferase  47.56 
 
 
226 aa  160  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3699  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 
186 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4669  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 
186 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.776305  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_004310  BR0089  phosphinothricin N-acetyltransferase  48.54 
 
 
179 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32151  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  48.28 
 
 
176 aa  158  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4023  GCN5-related N-acetyltransferase  48.52 
 
 
186 aa  158  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210755  normal  0.806566 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5631  GCN5-related N-acetyltransferase  46.11 
 
 
186 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.522089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1154  GCN5-related N-acetyltransferase  46.07 
 
 
186 aa  157  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0181286  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1467  phosphinothricin N-acetyltransferase  46.55 
 
 
188 aa  157  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0087  phosphinothricin N-acetyltransferase  47.95 
 
 
179 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1356  GCN5-related N-acetyltransferase  43.18 
 
 
181 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.181273  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1369  Phosphinothricin acetyltransferase  49.4 
 
 
177 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4882  GCN5-related N-acetyltransferase  45.93 
 
 
197 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256707  normal  0.880249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1899  GCN5-related N-acetyltransferase  50.62 
 
 
167 aa  156  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0856381  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3272  GCN5-related N-acetyltransferase  48.82 
 
 
210 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4517  GCN5-related N-acetyltransferase  45.3 
 
 
187 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.729154  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2530  phosphinothricin N-acetyltransferase  45.71 
 
 
247 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2866  GCN5-related N-acetyltransferase  46.24 
 
 
195 aa  155  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0345136 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1352  phosphinothricin N-acetyltransferase  45.71 
 
 
247 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1274  phosphinothricin N-acetyltransferase  45.71 
 
 
247 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3122  Phosphinothricin acetyltransferase  44.32 
 
 
176 aa  155  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1014  phosphinothricin N-acetyltransferase  45.71 
 
 
188 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1301  phosphinothricin N-acetyltransferase  45.71 
 
 
210 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1787  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  45.51 
 
 
200 aa  154  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000010061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0101  GCN5-related N-acetyltransferase  46.2 
 
 
193 aa  154  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0284  phosphinothricin N-acetyltransferase  45.71 
 
 
247 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0554  phosphinothricin N-acetyltransferase  45.71 
 
 
247 aa  154  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.450037  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4059  GCN5-related N-acetyltransferase  44.2 
 
 
207 aa  154  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0540643  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1606  GCN5-related N-acetyltransferase  45.18 
 
 
180 aa  151  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0984019  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3365  GCN5-related N-acetyltransferase  46.24 
 
 
188 aa  150  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00313605  hitchhiker  0.0000000000000200087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5489  GCN5-related N-acetyltransferase  45.88 
 
 
176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385408  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00885  phosphinothricin N-acetyltransferase  47.34 
 
 
179 aa  143  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203848  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2733  GCN5-related N-acetyltransferase  42.69 
 
 
184 aa  142  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3361  GCN5-related N-acetyltransferase  44.58 
 
 
168 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0225  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 
193 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296328 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0992  GCN5-related N-acetyltransferase  44.83 
 
 
191 aa  139  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0955  GCN5-related N-acetyltransferase  44.32 
 
 
204 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3655  Phosphinothricin acetyltransferase  41.46 
 
 
168 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2342  GCN5-related N-acetyltransferase  39.43 
 
 
180 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4064  GCN5-related N-acetyltransferase  43.48 
 
 
169 aa  130  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2407  GCN5-related N-acetyltransferase  42.25 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0933  GCN5-related N-acetyltransferase  44.07 
 
 
204 aa  128  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5144  Phosphinothricin acetyltransferase  40.37 
 
 
170 aa  127  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324669  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0386  Phosphinothricin acetyltransferase  43.92 
 
 
173 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0929  GCN5-related N-acetyltransferase  37.28 
 
 
186 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3131  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  37.21 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4403  GCN5-related N-acetyltransferase  40.57 
 
 
192 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  36.75 
 
 
186 aa  118  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3378  acetyltransferase  36.9 
 
 
180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3618  GCN5-related N-acetyltransferase  40.44 
 
 
198 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1500  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 
184 aa  111  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2779  GCN5-related N-acetyltransferase  34.76 
 
 
165 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229182  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00641  phosphinothricin N-acetyltransferase  40.27 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405677  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2457  GCN5-related N-acetyltransferase  32.3 
 
 
167 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1342  phosphinothricin N-acetyltransferase, putative  39.39 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.952982  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1596  acetyltransferase  40.12 
 
 
202 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1649  acetyltransferase  40.12 
 
 
164 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.336507  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1335  sortase related acyltransferase  31.64 
 
 
177 aa  106  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000322304  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1276  phosphinothricin acetyltransferase, putative  38.51 
 
 
170 aa  105  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2038  Phosphinothricin acetyltransferase  40.49 
 
 
175 aa  104  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1861  GCN5-related N-acetyltransferase  41.36 
 
 
177 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2571  phosphinothricin N-acetyltransferase  34.52 
 
 
169 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209959  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3936  GCN5-related N-acetyltransferase  43.06 
 
 
176 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0390446  decreased coverage  0.000407903 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
171 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3167  GCN5-related N-acetyltransferase  41.07 
 
 
171 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0287  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
184 aa  99.4  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>