More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3079 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  100 
 
 
301 aa  610  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1659  Rhodanese domain protein  71.85 
 
 
307 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000135994 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  70 
 
 
306 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  71.95 
 
 
304 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1666  thiosulfate sulfurtransferase  70.3 
 
 
303 aa  425  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200846  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  69.86 
 
 
297 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  69.15 
 
 
298 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  69.15 
 
 
298 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  69.15 
 
 
298 aa  418  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  67.91 
 
 
312 aa  411  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  69.1 
 
 
305 aa  414  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  68.35 
 
 
305 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1034  Rhodanese domain protein  67.69 
 
 
297 aa  403  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  66.44 
 
 
297 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  67.58 
 
 
304 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  64.54 
 
 
281 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  67.81 
 
 
297 aa  383  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  64.18 
 
 
281 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  63.96 
 
 
283 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  61.97 
 
 
289 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  64.77 
 
 
293 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  64.77 
 
 
293 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  60.14 
 
 
291 aa  357  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  57.14 
 
 
285 aa  345  8e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  54.64 
 
 
296 aa  334  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  55.4 
 
 
286 aa  332  4e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  56.52 
 
 
286 aa  331  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  48.76 
 
 
288 aa  296  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  51.97 
 
 
275 aa  295  6e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0296  rhodanese domain-containing protein  53.6 
 
 
301 aa  294  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  51.97 
 
 
277 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  52.19 
 
 
281 aa  293  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  51.97 
 
 
277 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  51.97 
 
 
277 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  51.81 
 
 
279 aa  291  7e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  52.13 
 
 
279 aa  291  9e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  51.97 
 
 
277 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  50.9 
 
 
277 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4642  Rhodanese domain protein  50.55 
 
 
275 aa  289  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0460  thiosulfate sulfurtransferase  51.09 
 
 
279 aa  287  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.755575  normal  0.367746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0340  rhodanese domain-containing protein  52.16 
 
 
282 aa  287  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316076  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6828  Rhodanese domain protein  50.9 
 
 
281 aa  286  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0902  rhodanese-like domain protein  50.9 
 
 
279 aa  285  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26463  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4230  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10830  thiosulfate sulfurtransferase cysA2  50.9 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13137  thiosulfate sulfurtransferase cysA3  50.9 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.34791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1030  Thiosulfate sulfurtransferase  50.53 
 
 
283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0259593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8246  Rhodanese domain protein  48.75 
 
 
287 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  52.55 
 
 
280 aa  280  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  50.18 
 
 
279 aa  280  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  50.54 
 
 
277 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0602  Thiosulfate sulfurtransferase  51.26 
 
 
279 aa  279  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6169  rhodanese domain-containing protein  52.55 
 
 
277 aa  278  9e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845163  normal  0.179847 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  48.94 
 
 
281 aa  271  1e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0449  rhodanese-like protein  51.46 
 
 
277 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.890664 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0059  thiosulfate sulfurtransferase  51.09 
 
 
279 aa  264  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  49.46 
 
 
282 aa  265  1e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  48.15 
 
 
295 aa  257  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  46.48 
 
 
293 aa  249  6e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  48.9 
 
 
355 aa  246  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  45.96 
 
 
285 aa  246  3e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  48.53 
 
 
321 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  45.88 
 
 
308 aa  244  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  47.31 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  48.16 
 
 
340 aa  242  6e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1210  rhodanese domain-containing protein  44.33 
 
 
289 aa  241  1e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  45.14 
 
 
297 aa  240  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2095  Rhodanese domain protein  44.79 
 
 
297 aa  237  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  45.52 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1687  Rhodanese domain protein  45.42 
 
 
290 aa  208  9e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0301278  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0995  Rhodanese domain protein  42.21 
 
 
296 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079295  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  40.07 
 
 
366 aa  196  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  41.22 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4850  Rhodanese domain protein  36.97 
 
 
277 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0194219  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  34.31 
 
 
273 aa  176  5e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4065  Rhodanese domain protein  34.98 
 
 
282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235987  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0356  rhodanese domain-containing protein  38.02 
 
 
267 aa  159  5e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  33.91 
 
 
276 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2858  Rhodanese domain protein  31.18 
 
 
305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1954  Rhodanese domain protein  33.9 
 
 
335 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.535428 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  34.89 
 
 
270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  32.76 
 
 
291 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2805  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 
362 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  33.84 
 
 
273 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  28.73 
 
 
258 aa  124  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.43 
 
 
289 aa  122  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  32.54 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.84 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  28.19 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.56 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  28.19 
 
 
321 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1689  rhodanese-like protein  30.48 
 
 
320 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.120717 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.09 
 
 
279 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  33.92 
 
 
288 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  29.79 
 
 
613 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  30.31 
 
 
285 aa  119  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  30.1 
 
 
271 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  33.11 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.88 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.56 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>