257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1824 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1824  cytidyltransferase-related domain  100 
 
 
146 aa  293  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257139  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4442  cytidyltransferase-related domain protein  60.16 
 
 
152 aa  156  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.437739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02680  cytidyltransferase-related enzyme  61.07 
 
 
148 aa  154  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0992  cytidyltransferase-related protein domain protein  58.78 
 
 
153 aa  152  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0886  cytidyltransferase-related domain protein  56.49 
 
 
147 aa  151  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.626022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4935  cytidyltransferase-related  54.96 
 
 
143 aa  147  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  42.19 
 
 
131 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3695  cytidyltransferase-like protein  42.19 
 
 
130 aa  100  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3930  cytidyltransferase-like protein  41.41 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4994  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
158 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327738  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  36.51 
 
 
132 aa  90.5  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4918  cytidyltransferase-related  36.22 
 
 
177 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  39.06 
 
 
129 aa  87.8  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  42.98 
 
 
132 aa  87.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0255  cytidyltransferase-like protein  38.17 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0245  cytidyltransferase-like protein  37.6 
 
 
512 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3377  cytidyltransferase-like protein  38.17 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  37.41 
 
 
185 aa  81.3  4e-15  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05830  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  40.98 
 
 
139 aa  81.3  4e-15  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.871653  hitchhiker  0.000166463 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  36.72 
 
 
167 aa  77.8  5e-14  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2068  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  36.22 
 
 
152 aa  77.4  6e-14  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1685  cytidyltransferase-like protein  40.91 
 
 
169 aa  76.6  1e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0819  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  40.14 
 
 
187 aa  75.9  2e-13  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2610  cytidyltransferase-related  43.2 
 
 
163 aa  73.9  7e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248173  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2791  cytidyltransferase-related domain protein  44.95 
 
 
163 aa  70.9  5e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2953  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  38.52 
 
 
131 aa  69.7  1e-11  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2696  cytidyltransferase-related domain protein  44.95 
 
 
163 aa  69.3  2e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0199265  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2577  cytidyltransferase-like protein  43.12 
 
 
160 aa  68.9  2e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.526786  normal  0.149536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1603  bifunctional D-beta-D-heptose 7-phosphate kinase/D-beta-D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase  35.61 
 
 
490 aa  68.2  4e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1823  cytidyltransferase-related domain  38.26 
 
 
386 aa  67.8  5e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  2.10752e-06  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1692  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  37.7 
 
 
133 aa  67.4  6e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16500  RfaeE domain II  38.94 
 
 
158 aa  67.4  6e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.08825e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0190  cytidyltransferase-like protein  35.92 
 
 
150 aa  67  8e-11  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.847612  normal  0.946455 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1304  cytidyltransferase-like protein  36.11 
 
 
156 aa  67  8e-11  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.494614  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2639  rfaE bifunctional protein  41.3 
 
 
461 aa  67  8e-11  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0750  cytidyltransferase-like protein  39.36 
 
 
150 aa  66.6  1e-10  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2003  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  33.87 
 
 
142 aa  65.5  2e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.10524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2321  cytidyltransferase-like protein  34.43 
 
 
143 aa  66.2  2e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27890  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  35.25 
 
 
133 aa  65.9  2e-10  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.90735  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3788  bifunctional ADP-heptose synthase  35.48 
 
 
223 aa  65.5  2e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1071  cytidyltransferase-related, RfaE bifunctional protein  37.23 
 
 
488 aa  65.1  3e-10  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0136639  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1615  bifunctional ADP-heptose synthase  34.85 
 
 
490 aa  65.1  3e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1432  bifunctional ADP-heptose synthase  36 
 
 
490 aa  64.7  4e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.588052 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1712  cytidyltransferase-like protein  35.45 
 
 
150 aa  64.7  4e-10  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0246  cytidyltransferase-like protein  35.51 
 
 
151 aa  64.7  4e-10  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1736  cytidyltransferase-like protein  37.84 
 
 
216 aa  64.3  6e-10  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.355762  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0113  cytidyltransferase-like protein  31.3 
 
 
139 aa  63.9  7e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0146  cytidyltransferase-related domain protein  36 
 
 
495 aa  63.9  7e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5668  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  39.78 
 
 
490 aa  63.9  7e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.381321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1486  cytidyltransferase-related domain protein  42.7 
 
 
170 aa  63.9  7e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.895055  normal  0.966364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4507  rfaE bifunctional protein  35.2 
 
 
490 aa  63.5  8e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1031  rfaE bifunctional protein  38.54 
 
 
501 aa  62.8  1e-09  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0268  rfaE bifunctional protein  39.81 
 
 
167 aa  62.8  1e-09  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3466  rfaE bifunctional protein  36.43 
 
 
159 aa  63.2  1e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3211  rfaE bifunctional protein  33.33 
 
 
490 aa  62.8  1e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.342523  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1299  bifunctional ADP-heptose synthase  35.11 
 
 
489 aa  62.8  2e-09  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  36.03 
 
 
464 aa  62.4  2e-09  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  7.37737e-06 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14660  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  34.43 
 
 
127 aa  60.8  6e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0290332  decreased coverage  2.46532e-07 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0977  rfaE bifunctional protein  34.09 
 
 
491 aa  60.8  6e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.673114  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0354  rfaE bifunctional protein  34.4 
 
 
486 aa  60.8  7e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0571  rfaE bifunctional protein  35.77 
 
 
486 aa  60.5  7e-09  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.861357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0123  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  38.71 
 
 
496 aa  60.5  8e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3591  rfaE bifunctional protein  32.58 
 
 
488 aa  59.7  1e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00169311  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1533  cytidylyltransferase  32.77 
 
 
116 aa  60.1  1e-08  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000327632  normal  0.335792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1422  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  36.89 
 
 
151 aa  59.7  1e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0864  rfaE bifunctional protein  35 
 
 
487 aa  59.3  2e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848286  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0769  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  36.96 
 
 
488 aa  58.2  3e-08  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00625792 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  34.11 
 
 
128 aa  58.9  3e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4553  rfaE bifunctional protein  36.63 
 
 
162 aa  57.8  4e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  35.48 
 
 
451 aa  57.8  6e-08  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0662  rfaE bifunctional protein  29.85 
 
 
485 aa  57.4  6e-08  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.148803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2084  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  32.26 
 
 
139 aa  57.4  7e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0657652  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2085  ADP-heptose synthase  35.35 
 
 
490 aa  57  8e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1575  cytidyltransferase-related domain protein  37.78 
 
 
501 aa  57  9e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.0217414 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4946  rfaE bifunctional protein  36.56 
 
 
488 aa  57  9e-08  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.169495 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1676  rfaE bifunctional protein  32.48 
 
 
162 aa  56.2  1e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1391  rfaE bifunctional protein  35.87 
 
 
488 aa  56.6  1e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.114301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0346  rfaE bifunctional protein  36.63 
 
 
185 aa  56.6  1e-07  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33520  predicted protein  41.3 
 
 
337 aa  56.6  1e-07  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0371958  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1704  rfaE bifunctional protein  33.87 
 
 
479 aa  56.6  1e-07  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3395  rfaE bifunctional protein  34.91 
 
 
487 aa  56.6  1e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0427  cytidyltransferase-related protein  32.43 
 
 
143 aa  55.5  2e-07  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1901  bifunctional ADP-heptose synthase  37.89 
 
 
179 aa  55.8  2e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0730146  normal  0.846811 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0342  rfaE bifunctional protein  35.87 
 
 
172 aa  55.5  2e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.699797 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0596  rfaE bifunctional protein  36.27 
 
 
151 aa  55.8  2e-07  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0922  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  31.2 
 
 
490 aa  55.8  2e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053941  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1282  putative ADP-heptose synthase  35.05 
 
 
490 aa  56.2  2e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0688  cytidyltransferase-like protein  37.63 
 
 
225 aa  55.8  2e-07  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0791  cytidyltransferase-like protein  35.85 
 
 
143 aa  55.8  2e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0616  rfaE bifunctional protein  30.11 
 
 
163 aa  55.5  3e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1969  rfaE bifunctional protein  31.62 
 
 
162 aa  55.5  3e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0577  udp-N-acetylglucosamine--n-acetylmuramyl- (pentapeptide)pyrophosphoryl -undecaprenol n-acetylglucosamine transferase (undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-udpglcnac glcnactransferase)  33.65 
 
 
472 aa  55.1  3e-07  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1895  rfaE bifunctional protein  36.84 
 
 
488 aa  55.1  3e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.200594 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  34.41 
 
 
358 aa  54.7  4e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  34.41 
 
 
358 aa  54.7  4e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3669  cytidyltransferase-related domain protein  33.93 
 
 
488 aa  54.3  5e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3773  rfaE bifunctional protein  36.56 
 
 
482 aa  54.3  6e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.889229  normal  0.588929 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0357  cytidyltransferase-like protein  33.87 
 
 
461 aa  54.3  6e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1750  cytidyltransferase-like protein  34.92 
 
 
502 aa  54.3  6e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1764  cytidyltransferase-like protein  34.92 
 
 
501 aa  54.3  6e-07  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>