34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0087 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0087  hypothetical protein  100 
 
 		 556 aa  1055    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0925  hypothetical protein  55.54 
 
 		 582 aa  503  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.45218  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0797  ABC transporter, ATPase, predicted  55.6 
 
 		 583 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1439  ATPase of the ABC class-like protein  41.78 
 
 		 566 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.363871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11360  predicted ATPase of the ABC class  41.61 
 
 		 581 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2198  hypothetical protein  48.15 
 
 		 568 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1834  ABC transporter, ATPase, predicted  46.69 
 
 		 570 aa  420  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2476  hypothetical protein  49.13 
 
 		 582 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5011  hypothetical protein  41.15 
 
 		 609 aa  406  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2553  ATPase family protein  42.91 
 
 		 568 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161385  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3562  ABC transporter ATPase  42.73 
 
 		 568 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1282  ATPase  39.72 
 
 		 570 aa  404  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0201259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0016  ABC transporter, ATPase, predicted  44.08 
 
 		 570 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.579046  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1322  ABC transporter, ATPase, predicted  41.43 
 
 		 568 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2333  hypothetical protein  39.44 
 
 		 567 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0273  hypothetical protein  45.57 
 
 		 561 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1512  ATPase family protein  36.46 
 
 		 573 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0956  hypothetical protein  38.45 
 
 		 567 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0661  ABC transporter ATPase  40.73 
 
 		 570 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0524  ABC transporter, ATPase, predicted  43.76 
 
 		 569 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1066  hypothetical protein  47.96 
 
 		 553 aa  368  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05520  predicted ATPase of the ABC class  46.52 
 
 		 564 aa  364  3e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000171  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  40.07 
 
 		 551 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358983  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23600  predicted ATPase of the ABC class  42.93 
 
 		 570 aa  350  4e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0593  hypothetical protein  38.42 
 
 		 548 aa  350  6e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.985204  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0727  hypothetical protein  40.11 
 
 		 549 aa  348  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.942995  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05805  hypothetical protein  38.7 
 
 		 551 aa  342  8e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43550  predicted protein  40.94 
 
 		 563 aa  293  4e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0957  ATPase of the ABC class-like protein  35.54 
 
 		 615 aa  229  9e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42881  predicted protein  34.91 
 
 		 699 aa  202  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0249417  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1968  hypothetical protein  33.85 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1059  hypothetical protein  29.62 
 
 		 459 aa  87.4  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.503801  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1915  hypothetical protein  32.46 
 
 		 456 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.108492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3781  ABC transporter related  32.8 
 
 		 259 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>