68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0043 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0043  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like  100 
 
 		 200 aa  390  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0211  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit  48.75 
 
 		 190 aa  148  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.330833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35430  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  44.72 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.428747 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3184  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  48.08 
 
 		 193 aa  139  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2436  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  42.86 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.425065 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3815  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  49.69 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.482932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0497  multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit-like protein  43.18 
 
 		 188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.701865  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0347  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  39.46 
 
 		 191 aa  118  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.244798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16770  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  38.18 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0549902  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25170  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  36.67 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0437176  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3657  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.73 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.67 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0668  cation antiporter  33.33 
 
 		 239 aa  97.1  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5211  cation antiporter  38.96 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0000518412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0595  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.61 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.463718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0583  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.61 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0573  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  38.61 
 
 		 189 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.933363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0741  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  36.08 
 
 		 179 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.60471 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18940  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  31.85 
 
 		 205 aa  86.3  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3947  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  39.24 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.109744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4627  cation antiporter  35.54 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3717  cation antiporter  33.54 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05180  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  34.31 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6652  Multisubunit Na+/H+ antiporter MnhE subunit- like protein  36.59 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14780  multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhE subunit  31.88 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4891  cation antiporter  31.28 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0165  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  35.17 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.792787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0868  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  26.35 
 
 		 157 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.146025  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0078  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  30.19 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2031  cation antiporter  26.8 
 
 		 157 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0752  cation antiporter  23.6 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0276366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2487  cation antiporter  30.95 
 
 		 162 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0732  cation antiporter  31.13 
 
 		 117 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.166918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1124  hypothetical protein  30 
 
 		 158 aa  52  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104853  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000415  Na(+) H(+) antiporter subunit E  28.95 
 
 		 158 aa  51.6  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2524  cation antiporter  24.64 
 
 		 157 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2859  cation antiporter  22.88 
 
 		 157 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0708452  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3854  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.57 
 
 		 162 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.911749 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2870  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.16 
 
 		 158 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.4 
 
 		 163 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0995  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.4 
 
 		 163 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.389064  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0136  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  21.88 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.904679  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0534  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.56 
 
 		 159 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3691  cation antiporter  24.68 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0098  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.28 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.67 
 
 		 166 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0967  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.06 
 
 		 159 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.259527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0948  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.06 
 
 		 159 aa  46.2  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2579  cation antiporter  27.22 
 
 		 175 aa  45.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1771  Na(+)/H(+) antiporter subunit E  24.32 
 
 		 115 aa  45.1  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3535  cation antiporter  28.21 
 
 		 111 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0624432  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1004  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.89 
 
 		 157 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0000854262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3985  cation antiporter  28.57 
 
 		 161 aa  45.1  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0060  cation antiporter  25.16 
 
 		 165 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3808  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.85 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0404  sodium/proton antiporter protein  24.32 
 
 		 115 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0611  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.26 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2340  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.97 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0438  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.29 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0503  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  25.29 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  27.63 
 
 		 157 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3222  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  28.67 
 
 		 157 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0033  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit E  24.14 
 
 		 161 aa  42  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2094  cation antiporter  27.43 
 
 		 159 aa  42  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1032  hypothetical protein  31.25 
 
 		 171 aa  42  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0676614 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1159  cation antiporter  28.79 
 
 		 159 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0564  cation antiporter  27.66 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2926  cation antiporter  28.57 
 
 		 170 aa  41.6  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000185447  normal  0.62241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>