59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1565 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  42.04 
 
 
1114 aa  752    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  44.72 
 
 
1125 aa  805    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  45.65 
 
 
1120 aa  827    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  100 
 
 
1151 aa  2319    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  37.16 
 
 
1146 aa  597  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  30.4 
 
 
1124 aa  370  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  29.45 
 
 
1143 aa  319  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  28.07 
 
 
1126 aa  309  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  27.59 
 
 
1128 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  28.43 
 
 
1118 aa  290  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  26.65 
 
 
1137 aa  271  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  25.27 
 
 
1136 aa  248  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  28.01 
 
 
1120 aa  244  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  26.4 
 
 
1120 aa  239  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  24.64 
 
 
1120 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  25.85 
 
 
1154 aa  236  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  24.64 
 
 
1120 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  25.17 
 
 
1126 aa  235  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  26.5 
 
 
1153 aa  231  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  24.47 
 
 
1118 aa  231  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  24.85 
 
 
1121 aa  207  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  25.15 
 
 
1123 aa  193  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  22.2 
 
 
1122 aa  189  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  24.96 
 
 
1130 aa  188  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  23.7 
 
 
1121 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  22.49 
 
 
1121 aa  182  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  22.7 
 
 
1133 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  22.25 
 
 
1121 aa  179  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  22.57 
 
 
1121 aa  177  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  24.26 
 
 
1125 aa  173  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  22.95 
 
 
1121 aa  168  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  22.62 
 
 
1125 aa  166  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  24.15 
 
 
1124 aa  165  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  22.41 
 
 
1143 aa  150  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  22.57 
 
 
1144 aa  150  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  23.88 
 
 
1045 aa  145  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  24.62 
 
 
694 aa  141  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  23.51 
 
 
1140 aa  141  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  23.57 
 
 
979 aa  135  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  24.51 
 
 
1133 aa  122  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  24.22 
 
 
1166 aa  91.7  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  37.6 
 
 
1181 aa  76.6  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  26.19 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  22.06 
 
 
1113 aa  61.6  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  22.67 
 
 
462 aa  60.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  23.93 
 
 
406 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  22.61 
 
 
1140 aa  57.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  21.56 
 
 
1141 aa  53.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0098  hypothetical protein  29.29 
 
 
1214 aa  48.5  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  24.43 
 
 
1159 aa  48.5  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  21.13 
 
 
1138 aa  48.5  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  31.52 
 
 
1107 aa  47  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  21.31 
 
 
1093 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  29.27 
 
 
1145 aa  46.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  31.4 
 
 
1159 aa  45.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  31.4 
 
 
1159 aa  45.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  31.4 
 
 
1159 aa  45.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2198  cell division protein MukB  37.88 
 
 
1477 aa  45.1  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  34.62 
 
 
1109 aa  45.1  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>