41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3028 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3028  virulence protein, SciE type  100 
 
 
265 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0281455  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6048  hypothetical protein  39.92 
 
 
275 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3074  virulence protein, SciE type  39.38 
 
 
271 aa  142  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1532  hypothetical protein  31.93 
 
 
277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2366  virulence protein, SciE type  24.31 
 
 
262 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000023  protein of avirulence locus ImpE  25.91 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.692484  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0525  virulence protein SciE type  27.27 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1478  virulence protein, SciE type  27.68 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3010  virulence protein SciE type  27.84 
 
 
284 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177005  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2327  virulence protein, SciE type  28.84 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0365801 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0293  SciE protein  26.24 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.816472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0295  SciE protein  26.24 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.227917 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0300  SciE protein  25.86 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0308  hypothetical protein  25.86 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.914397 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00263  ImpE protein  29.96 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2453  virulence protein SciE type  26.22 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0611141  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1686  virulence protein SciE type  22.81 
 
 
275 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.207214  normal  0.113631 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6691  virulence protein SciE type  28.8 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3856  virulence protein SciE type  27.2 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271888  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0196  virulence protein SciE type  30 
 
 
288 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0158  virulence protein, SciE type  30.38 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0977  virulence protein, SciE type  27.91 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3009  virulence protein SciE type  30.71 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232127  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01040  putative secretion protein  29.36 
 
 
281 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3471  virulence protein, SciE type  28.03 
 
 
283 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  0.687 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6117  virulence protein SciE type  24.71 
 
 
288 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal  0.445465 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0174  ImpE/SciE family protein  26.42 
 
 
268 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0152  ImpE/SciE family protein  26.42 
 
 
268 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1623  SciE protein  26.42 
 
 
284 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0246  ImpE/SciE family protein  29.89 
 
 
321 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1698  ImpE protein superfamily protein  29.89 
 
 
321 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1931  hypothetical protein  22.64 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.350891  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1377  ImpE family protein  22.64 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1489  virulence protein SciE type  22.64 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747548  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0138  ImpE protein superfamily protein  23.65 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0337  ImpE/SciE family protein  29.89 
 
 
321 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2179  ImpE/SciE family protein  28.26 
 
 
321 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1204  hypothetical protein  28.26 
 
 
321 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0917  hypothetical protein  28.26 
 
 
321 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1906  hypothetical protein  28.26 
 
 
321 aa  42.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306251  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0944  virulence protein SciE type  25.51 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>