51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3780 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3780  protein of unknown function DUF35  100 
 
 
126 aa  253  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000111928  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2808  protein of unknown function DUF35  51.64 
 
 
128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0884467  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1005  protein of unknown function DUF35  52.71 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.966695  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  51.26 
 
 
134 aa  124  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0598  protein of unknown function DUF35  48.74 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0897  protein of unknown function DUF35  51.18 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  29.75 
 
 
177 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  37.76 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  35.05 
 
 
135 aa  56.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  33.06 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  33.94 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  25.86 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  26.05 
 
 
189 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  28.81 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  38.71 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  31.78 
 
 
137 aa  47  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  39.29 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  29.23 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  28.69 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  35.04 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  35.04 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  35.04 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  25.81 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  24.05 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  26.67 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  38.46 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  36 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  35.62 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  31.67 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  30.3 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  23.68 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  30.53 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  32.04 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  32.04 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  27.12 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2285  protein of unknown function DUF35  36.14 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.0066247  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  34.72 
 
 
133 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  29.75 
 
 
131 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  31.87 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  31.15 
 
 
550 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  31.15 
 
 
550 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  25.27 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  30.23 
 
 
123 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  34.94 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  25.27 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  35.29 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  25.27 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  30.4 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  28.33 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  31.51 
 
 
145 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  23.91 
 
 
129 aa  40  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>