49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0598 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0598  protein of unknown function DUF35  100 
 
 
127 aa  253  5e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2476  protein of unknown function DUF35  57.26 
 
 
134 aa  144  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73466  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1005  protein of unknown function DUF35  50.39 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.966695  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2808  protein of unknown function DUF35  47.2 
 
 
128 aa  123  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0884467  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0897  protein of unknown function DUF35  51.64 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3780  protein of unknown function DUF35  48.74 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000111928  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  37.07 
 
 
177 aa  77.4  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  30.77 
 
 
178 aa  59.7  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  29.66 
 
 
182 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  30.43 
 
 
189 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  28.45 
 
 
576 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  26.13 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  28.16 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  29.76 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  28.85 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  31.96 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  28.57 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  33.66 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  30.43 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  28.33 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  29.87 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  29.87 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  32.89 
 
 
133 aa  47  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  29.41 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  29.87 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  30.48 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  29.46 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  31.33 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  30.95 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3522  protein of unknown function DUF35  38.37 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  27.12 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  29.91 
 
 
311 aa  44.3  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  28.26 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  28.75 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2285  protein of unknown function DUF35  37.21 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.0066247  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  31.73 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  27.17 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  29.33 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  33.8 
 
 
140 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  29.87 
 
 
129 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  26.97 
 
 
141 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  30.77 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  30.77 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  35.14 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  29.31 
 
 
319 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  29.31 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  27.34 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3090  protein of unknown function DUF35  34.25 
 
 
335 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  27.36 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>