More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1735 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  68.16 
 
 
531 aa  754    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  56.2 
 
 
516 aa  637    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  61.63 
 
 
513 aa  666    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  58.98 
 
 
517 aa  642    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  58.72 
 
 
515 aa  639    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  58.91 
 
 
515 aa  641    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  57.78 
 
 
510 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  59.88 
 
 
516 aa  664    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  64.83 
 
 
516 aa  649    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  58.75 
 
 
510 aa  641    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  61.43 
 
 
511 aa  649    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  61.35 
 
 
520 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  61.75 
 
 
510 aa  657    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  58.17 
 
 
514 aa  645    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  62.57 
 
 
518 aa  692    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  59.73 
 
 
514 aa  638    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  59.57 
 
 
513 aa  638    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  58.56 
 
 
510 aa  646    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  100 
 
 
516 aa  1063    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  60.97 
 
 
510 aa  653    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  65.48 
 
 
519 aa  690    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  65.48 
 
 
520 aa  690    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  61.36 
 
 
516 aa  665    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  58.79 
 
 
522 aa  641    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  62.13 
 
 
508 aa  667    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  61.28 
 
 
510 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  60.35 
 
 
530 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  57.75 
 
 
516 aa  645    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  60.35 
 
 
529 aa  642    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  60.89 
 
 
510 aa  649    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  60.89 
 
 
510 aa  650    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  91.47 
 
 
516 aa  924    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  62.79 
 
 
528 aa  675    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  61.87 
 
 
522 aa  654    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  62.17 
 
 
518 aa  654    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  57.98 
 
 
510 aa  642    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  62.23 
 
 
550 aa  674    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  56.2 
 
 
516 aa  637    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  57.17 
 
 
516 aa  645    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  60.16 
 
 
512 aa  649    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1754  carboxyl transferase  59.92 
 
 
510 aa  638    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.218371  normal  0.119502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  65.68 
 
 
519 aa  689    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  61.48 
 
 
514 aa  669    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  62.72 
 
 
522 aa  679    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  78.68 
 
 
531 aa  857    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  59.42 
 
 
510 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  60.12 
 
 
510 aa  643    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  65.68 
 
 
519 aa  691    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  60.65 
 
 
537 aa  649    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  59.61 
 
 
510 aa  640    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  60.58 
 
 
510 aa  639    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  60.31 
 
 
519 aa  640    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  58.56 
 
 
517 aa  637    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  71.51 
 
 
516 aa  799    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  59.14 
 
 
513 aa  641    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  64.49 
 
 
516 aa  667    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  61.67 
 
 
510 aa  663    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  61.17 
 
 
510 aa  656    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  61.94 
 
 
510 aa  658    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  60.58 
 
 
510 aa  642    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  61.28 
 
 
510 aa  644    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  60.66 
 
 
516 aa  666    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  58.37 
 
 
510 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  58.37 
 
 
510 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  61.39 
 
 
514 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  58.56 
 
 
510 aa  637    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  57.98 
 
 
510 aa  641    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  59.14 
 
 
513 aa  644    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  62.14 
 
 
530 aa  657    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  57.98 
 
 
510 aa  642    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  61.87 
 
 
516 aa  633  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5024  putative propionyl-CoA carboxylase beta chain  58.56 
 
 
510 aa  632  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.541202 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  58.75 
 
 
512 aa  634  1e-180  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  57.53 
 
 
517 aa  632  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  60.86 
 
 
510 aa  631  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  58.75 
 
 
513 aa  629  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3397  carboxyl transferase  57.59 
 
 
510 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  58.95 
 
 
510 aa  630  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  58.17 
 
 
518 aa  630  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  58.17 
 
 
512 aa  626  1e-178  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  58.64 
 
 
510 aa  627  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  57.98 
 
 
510 aa  626  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  59.3 
 
 
531 aa  627  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  57.86 
 
 
523 aa  627  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  57.78 
 
 
510 aa  627  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0272  carboxyl transferase  56.25 
 
 
515 aa  625  1e-178  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00889461 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  58.95 
 
 
510 aa  627  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  60.82 
 
 
524 aa  627  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  58.95 
 
 
510 aa  624  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  58.17 
 
 
510 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0808  carboxyl transferase  60.39 
 
 
508 aa  622  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3122  carboxyl transferase  57.59 
 
 
510 aa  621  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629263  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  57.78 
 
 
510 aa  624  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  58.17 
 
 
510 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  58.17 
 
 
510 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  57.14 
 
 
564 aa  623  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  60.16 
 
 
551 aa  621  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  56.61 
 
 
517 aa  619  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  59.64 
 
 
521 aa  618  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  58.88 
 
 
527 aa  618  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>