More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6062 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.4 
 
 
476 aa  655    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.37 
 
 
462 aa  660    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  73 
 
 
470 aa  707    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.73 
 
 
462 aa  650    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7380  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.98 
 
 
484 aa  655    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230144  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  68.38 
 
 
468 aa  648    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.92 
 
 
476 aa  664    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.3 
 
 
468 aa  637    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.26 
 
 
475 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.38 
 
 
465 aa  639    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  66.94 
 
 
530 aa  640    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.5 
 
 
521 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.6 
 
 
469 aa  635    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.38 
 
 
465 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
469 aa  636    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
469 aa  636    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
469 aa  636    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.78 
 
 
474 aa  650    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.5 
 
 
521 aa  637    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.36 
 
 
470 aa  702    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  67.86 
 
 
547 aa  639    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1466  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.25 
 
 
485 aa  651    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0580828 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.22 
 
 
537 aa  635    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.46 
 
 
484 aa  656    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.186879 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.43 
 
 
475 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  67.52 
 
 
467 aa  639    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.79 
 
 
462 aa  662    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.29 
 
 
476 aa  662    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.43 
 
 
482 aa  650    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.34 
 
 
471 aa  655    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.73 
 
 
470 aa  699    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.43 
 
 
475 aa  637    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.21 
 
 
468 aa  718    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.21 
 
 
468 aa  718    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.55 
 
 
480 aa  665    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.37 
 
 
482 aa  657    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.23 
 
 
462 aa  654    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.08 
 
 
462 aa  659    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54086  predicted protein  68.06 
 
 
501 aa  644    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0980495  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.78 
 
 
470 aa  704    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.28 
 
 
470 aa  653    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  67.45 
 
 
465 aa  638    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
469 aa  636    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.37 
 
 
465 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.83 
 
 
493 aa  638    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  68.78 
 
 
503 aa  640    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.38 
 
 
474 aa  644    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.66 
 
 
462 aa  659    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.8 
 
 
473 aa  649    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.52 
 
 
482 aa  685    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.56 
 
 
470 aa  657    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.09 
 
 
476 aa  648    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.79 
 
 
481 aa  663    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.3 
 
 
468 aa  637    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4106  ATP synthase F1, beta subunit  69.3 
 
 
485 aa  642    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
474 aa  637    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.62 
 
 
471 aa  673    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.67 
 
 
476 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.91 
 
 
478 aa  661    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.46 
 
 
484 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106818  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.85 
 
 
467 aa  687    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.09 
 
 
476 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.32 
 
 
481 aa  724    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.09 
 
 
476 aa  657    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.02 
 
 
509 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4737  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.32 
 
 
542 aa  639    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603739  decreased coverage  0.00210198 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 
484 aa  635    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.62 
 
 
474 aa  654    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6062  ATP synthase F1, beta subunit  100 
 
 
481 aa  972    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.38 
 
 
484 aa  638    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0343  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
483 aa  643    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050058 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 
462 aa  640    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.42 
 
 
519 aa  671    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.73 
 
 
471 aa  698    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.16 
 
 
465 aa  647    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
465 aa  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.5 
 
 
517 aa  645    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  66.67 
 
 
482 aa  646    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1744  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.25 
 
 
485 aa  651    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0920957  normal  0.184526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.49 
 
 
484 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.23 
 
 
472 aa  640    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4484  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.52 
 
 
482 aa  685    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3366  ATP synthase F1, beta subunit  68.92 
 
 
469 aa  640    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.83 
 
 
472 aa  643    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
469 aa  638    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6635  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.98 
 
 
484 aa  654    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.36 
 
 
470 aa  702    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4503  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.52 
 
 
482 aa  685    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.7 
 
 
478 aa  656    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.41 
 
 
469 aa  681    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.3 
 
 
474 aa  640    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0218  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.62 
 
 
482 aa  654    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.933064  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.62 
 
 
464 aa  640    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  65.38 
 
 
487 aa  656    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.83 
 
 
471 aa  674    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.17 
 
 
465 aa  631  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.51 
 
 
472 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.5 
 
 
474 aa  632  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.6 
 
 
468 aa  631  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
464 aa  633  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>