21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6059 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6059  Thrombospondin type 3 repeat protein  100 
 
 		 292 aa  536  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2435  Thrombospondin type 3 repeat protein  48.29 
 
 		 522 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.492834 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  43.95 
 
 		 852 aa  87.4  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  43.09 
 
 		 3662 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  39.08 
 
 		 780 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  29.58 
 
 		 722 aa  57.4  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  31.78 
 
 		 792 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00819  hypothetical protein  37.5 
 
 		 823 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3626  hypothetical protein  41.57 
 
 		 576 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00173227  normal  0.0443221 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  31.42 
 
 		 722 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  33.49 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6058  hypothetical protein  42.53 
 
 		 353 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3470  hypothetical protein  51.11 
 
 		 2836 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0237631 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 727 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  28.65 
 
 		 487 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.45 
 
 		 427 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3289  PHB depolymerase family esterase  61.11 
 
 		 683 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  37.74 
 
 		 478 aa  43.5  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  54.05 
 
 		 1265 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0658  PHB depolymerase family esterase  61.11 
 
 		 683 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.726264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  30.77 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>