More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5927 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5927  thioredoxin  100 
 
 
110 aa  228  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  60.91 
 
 
110 aa  153  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  58.18 
 
 
110 aa  144  4e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2496  thioredoxin  59.09 
 
 
109 aa  144  4e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.182202  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1456  thioredoxin  58.18 
 
 
109 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1359  thioredoxin  58.18 
 
 
109 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  59.6 
 
 
115 aa  135  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  57.14 
 
 
109 aa  135  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  4.29326e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  54.72 
 
 
107 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  54.72 
 
 
107 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  54.72 
 
 
107 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  54.72 
 
 
107 aa  134  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0505  thioredoxin  51.38 
 
 
109 aa  134  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000129794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3067  thioredoxin  52.29 
 
 
109 aa  134  6e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.788534  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  50.46 
 
 
109 aa  133  6e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  52.83 
 
 
148 aa  133  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3080  thioredoxin  59.6 
 
 
108 aa  133  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  53.85 
 
 
108 aa  132  1e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  7.56824e-06  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  53.77 
 
 
107 aa  133  1e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1283  thioredoxin 1  54.13 
 
 
109 aa  132  1e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.149215  normal  0.0874847 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  53.77 
 
 
107 aa  133  1e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  55 
 
 
107 aa  130  4e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  54.81 
 
 
114 aa  130  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  54.55 
 
 
106 aa  130  7e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  55.05 
 
 
108 aa  130  7e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  48.62 
 
 
109 aa  130  8e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  50.96 
 
 
108 aa  129  1e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  55.96 
 
 
108 aa  129  1e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  6.55412e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  51.43 
 
 
108 aa  129  1e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  56.25 
 
 
107 aa  129  1e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  129  2e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  129  2e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  129  2e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  129  2e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  129  2e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  51.89 
 
 
107 aa  129  2e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  53.54 
 
 
106 aa  128  2e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  53.21 
 
 
108 aa  129  2e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0398  thioredoxin  48.62 
 
 
108 aa  129  2e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  51.89 
 
 
125 aa  129  2e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  129  2e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  51.96 
 
 
108 aa  128  2e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  51.89 
 
 
107 aa  129  2e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  52.38 
 
 
146 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  49.54 
 
 
108 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  50.91 
 
 
110 aa  128  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  50.91 
 
 
110 aa  128  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  50.91 
 
 
110 aa  128  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  50.91 
 
 
133 aa  128  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  50.94 
 
 
107 aa  128  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  53.21 
 
 
109 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  52.38 
 
 
146 aa  127  4e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  127  4e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  52.38 
 
 
108 aa  127  5e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  50 
 
 
124 aa  127  6e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  51.89 
 
 
107 aa  127  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  50.48 
 
 
108 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  51.55 
 
 
108 aa  127  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  4.17679e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  50.96 
 
 
108 aa  127  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  52.94 
 
 
109 aa  127  7e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  126  8e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  50 
 
 
108 aa  126  9e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  54.55 
 
 
108 aa  126  1e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  8.76713e-08  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  126  1e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  54.46 
 
 
108 aa  126  1e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  52.29 
 
 
108 aa  126  1e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  49.04 
 
 
120 aa  125  1e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  54.13 
 
 
108 aa  125  2e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  53.21 
 
 
108 aa  125  2e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  53 
 
 
107 aa  125  2e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.30429e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  55.45 
 
 
108 aa  125  2e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  53.21 
 
 
108 aa  125  2e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  52.29 
 
 
108 aa  125  2e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  52.29 
 
 
108 aa  125  2e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  53.21 
 
 
108 aa  125  2e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0428  thioredoxin  50.49 
 
 
110 aa  125  2e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  52.29 
 
 
108 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  54.74 
 
 
107 aa  124  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  49.09 
 
 
110 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  46.79 
 
 
108 aa  124  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  47.71 
 
 
109 aa  125  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  51 
 
 
105 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  53.61 
 
 
108 aa  124  4e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2065  thioredoxin  55.34 
 
 
110 aa  124  4e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.568423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  50.46 
 
 
109 aa  124  4e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  53.47 
 
 
108 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  48.18 
 
 
110 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  53 
 
 
107 aa  124  5e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  7.62931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  49.02 
 
 
108 aa  124  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  50.46 
 
 
112 aa  124  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  46.79 
 
 
109 aa  123  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  52.94 
 
 
108 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  52.88 
 
 
259 aa  123  8e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>