More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5621 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 325 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  32.36 
 
 		 360 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  35.4 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  35.4 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  34.46 
 
 		 323 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  31.66 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  34.69 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  36.06 
 
 		 328 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  31.87 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  34.18 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  33.12 
 
 		 336 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  35.24 
 
 		 329 aa  164  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  33.05 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  31.76 
 
 		 372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  32.14 
 
 		 362 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  34.47 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  34.71 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  34.8 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  32.82 
 
 		 364 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  31.55 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  35.08 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  33.52 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  33.23 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  30.85 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  32.92 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  34.04 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  33.63 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  31.53 
 
 		 347 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  33.54 
 
 		 349 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  31.78 
 
 		 316 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.46 
 
 		 316 aa  152  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.43 
 
 		 319 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.63 
 
 		 316 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  30.14 
 
 		 353 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.46 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  34.24 
 
 		 329 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  31.11 
 
 		 355 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  30.12 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.31 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3224  putative GTP-binding protein YjiA  35.33 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0778191  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  34.44 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  34.44 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  43.65 
 
 		 449 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  30.7 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  43.09 
 
 		 449 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1091  putative GTP-binding protein YjiA  34.97 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  29.6 
 
 		 327 aa  149  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.63 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.63 
 
 		 316 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  29.05 
 
 		 353 aa  149  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  44.2 
 
 		 452 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  43.09 
 
 		 457 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  43.09 
 
 		 460 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  34.85 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3645  cobalamin synthesis protein P47K  32.91 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  30.31 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  42.54 
 
 		 460 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  31.38 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  43.09 
 
 		 449 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  29.03 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  33.94 
 
 		 335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  42.54 
 
 		 460 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  29.04 
 
 		 342 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4943  putative GTP-binding protein YjiA  34.19 
 
 		 318 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.715992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  32.19 
 
 		 349 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4936  putative GTP-binding protein YjiA  34.19 
 
 		 318 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.518194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4884  putative GTP-binding protein YjiA  33.87 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4878  putative GTP-binding protein YjiA  33.23 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4783  putative GTP-binding protein YjiA  34.19 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.120567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  31.07 
 
 		 350 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  29.13 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  31.8 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  33.85 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  31.32 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  32.42 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  30.64 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4572  putative GTP-binding protein YjiA  32.91 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04218  predicted GTPase  32.91 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  36.61 
 
 		 407 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04184  hypothetical protein  32.91 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4944  putative GTP-binding protein YjiA  32.91 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3714  putative GTP-binding protein YjiA  32.91 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5864  putative GTP-binding protein YjiA  32.91 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  31.41 
 
 		 369 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4892  putative GTP-binding protein YjiA  32.91 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  32.55 
 
 		 339 aa  143  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  34.15 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  34.24 
 
 		 350 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  34.07 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0509  putative GTP-binding protein YjiA  32.69 
 
 		 317 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  32.14 
 
 		 343 aa  142  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  30.17 
 
 		 362 aa  142  9e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4857  putative GTP-binding protein YjiA  33.55 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  41.67 
 
 		 358 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.5 
 
 		 386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  35.11 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.42 
 
 		 390 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  34.57 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  31.58 
 
 		 375 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  35.11 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>