More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2560 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
420 aa  828    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0912  hypothetical protein  38.31 
 
 
412 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0518  hypothetical protein  35.21 
 
 
419 aa  250  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  33.25 
 
 
417 aa  229  6e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  33.41 
 
 
424 aa  224  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  31.9 
 
 
420 aa  223  7e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  33.41 
 
 
424 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  32.93 
 
 
424 aa  219  7e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  33.42 
 
 
430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  30.72 
 
 
434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  30.31 
 
 
424 aa  210  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  34.48 
 
 
431 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  27.54 
 
 
414 aa  206  5e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  31.84 
 
 
427 aa  206  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  34.52 
 
 
434 aa  206  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0385  protein of unknown function DUF21  29.02 
 
 
434 aa  204  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237967  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  31.3 
 
 
445 aa  204  3e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  33.5 
 
 
425 aa  203  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  33.8 
 
 
447 aa  203  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2811  hypothetical protein  29.58 
 
 
421 aa  202  7e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  34.57 
 
 
444 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2680  hypothetical protein  29.83 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  32.08 
 
 
477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  32.68 
 
 
468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04200  putative hemolysin  31.89 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.545831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  32.27 
 
 
432 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  32.84 
 
 
443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  29.98 
 
 
434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  32.85 
 
 
467 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  32.37 
 
 
432 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  31.97 
 
 
430 aa  196  9e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  32.47 
 
 
425 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 
421 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  33.25 
 
 
445 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2371  transmembrane protein  33.1 
 
 
432 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.242025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  32.44 
 
 
447 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  34.15 
 
 
429 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  30.32 
 
 
455 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  31.03 
 
 
438 aa  194  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  33.1 
 
 
470 aa  193  5e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  32.44 
 
 
440 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  32.08 
 
 
429 aa  192  8e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  31.71 
 
 
426 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  31.58 
 
 
438 aa  192  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0842  protein of unknown function DUF21  31.54 
 
 
430 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  30.79 
 
 
421 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  31.72 
 
 
445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  31.72 
 
 
445 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  31.23 
 
 
455 aa  190  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  31.22 
 
 
455 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  33.42 
 
 
426 aa  189  9e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  30.54 
 
 
421 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0384  CBS domain containing protein  28.67 
 
 
433 aa  189  9e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548164  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  28.78 
 
 
429 aa  189  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  31.68 
 
 
431 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  31.64 
 
 
437 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  32.86 
 
 
433 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  30.1 
 
 
448 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1414  hypothetical protein  29.71 
 
 
419 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
439 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  29.43 
 
 
428 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  32.05 
 
 
454 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  30.73 
 
 
446 aa  186  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  28.4 
 
 
426 aa  186  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2633  protein of unknown function DUF21  34.61 
 
 
425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  31.87 
 
 
434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  33.72 
 
 
465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1275  protein of unknown function DUF21  29.78 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1568  predicted protein  33.09 
 
 
420 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000880884  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  28.23 
 
 
428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  28.22 
 
 
422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  30.51 
 
 
446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3019  hypothetical protein  28.29 
 
 
427 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00496912  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  29.85 
 
 
429 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0886  hypothetical protein  30.57 
 
 
429 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  30.59 
 
 
428 aa  183  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  30.71 
 
 
436 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  29.9 
 
 
435 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  26.19 
 
 
440 aa  182  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  28.92 
 
 
446 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  31.03 
 
 
464 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0451  CBS domain-containing protein  29.38 
 
 
417 aa  181  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.247844 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  31.43 
 
 
422 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3477  hypothetical protein  33.1 
 
 
458 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0407  protein of unknown function DUF21  32.47 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.426667  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3540  hypothetical protein  33.1 
 
 
458 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228644  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3490  hypothetical protein  33.1 
 
 
458 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  31.37 
 
 
447 aa  180  4.999999999999999e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  27.14 
 
 
427 aa  179  5.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  29.73 
 
 
442 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  33.49 
 
 
444 aa  179  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0469  hypothetical protein  29.57 
 
 
426 aa  179  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  31.14 
 
 
436 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  31.91 
 
 
434 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  29.48 
 
 
442 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  27.75 
 
 
424 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1176  protein of unknown function DUF21  32.26 
 
 
426 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50437  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  31.78 
 
 
443 aa  178  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  29 
 
 
427 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  28.36 
 
 
413 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>