104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0092 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0092  protein of unknown function DUF1330  100 
 
 
96 aa  199  8e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.273128  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1655  protein of unknown function DUF1330  98.96 
 
 
96 aa  197  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  34.74 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  38.3 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  33.68 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  36.56 
 
 
95 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  29.79 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  31.18 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  31.91 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  30.11 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1076  hypothetical protein  34.04 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262747  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  29.79 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1844  hypothetical protein  29.9 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  29.03 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1504  hypothetical protein  34.25 
 
 
127 aa  61.6  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  29.47 
 
 
104 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  27.96 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  28.72 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  31.25 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  25.81 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  31.91 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3894  hypothetical protein  36.67 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2552  hypothetical protein  36.59 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758966  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  30.85 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  30.85 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  28.26 
 
 
97 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3978  glucose inhibited division protein  31.91 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.174401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  28.57 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  32.63 
 
 
97 aa  52.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  30.85 
 
 
102 aa  52.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  32.58 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  28.12 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  32.89 
 
 
112 aa  52  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  30.11 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  31.25 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5218  hypothetical protein  30.85 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4583  hypothetical protein  32.89 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  30.43 
 
 
100 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1336  hypothetical protein  25.53 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000449884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  25.81 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  32.98 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3403  hypothetical protein  28.42 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2309  hypothetical protein  28.26 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2715  hypothetical protein  30.61 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3743  hypothetical protein  27.37 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.679918 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3454  hypothetical protein  28.42 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.516869  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  24.18 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4067  hypothetical protein  28.42 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  27.17 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  28.26 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0310  hypothetical protein  31.33 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  27.37 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5237  hypothetical protein  27.37 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1452  hypothetical protein  27.17 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  27.96 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  27.17 
 
 
95 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6638  hypothetical protein  29.17 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1194  hypothetical protein  29.17 
 
 
107 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707621  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  28.95 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  27.66 
 
 
98 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5793  hypothetical protein  29.17 
 
 
95 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6158  hypothetical protein  29.17 
 
 
95 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  27.66 
 
 
98 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  27.66 
 
 
98 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1673  hypothetical protein  27.16 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  27.47 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4644  protein of unknown function DUF1330  25.26 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0263146  normal  0.598238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  27.47 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0176  protein of unknown function DUF1330  26.09 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3118  protein of unknown function DUF1330  31.11 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  27.17 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0958  hypothetical protein  27.66 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7348  hypothetical protein  27.08 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.310793  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7719  hypothetical protein  30.59 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0421  hypothetical protein  27.66 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0223  hypothetical protein  27.66 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0195535  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1378  hypothetical protein  27.66 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  27.17 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  38.81 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1128  hypothetical protein  28.26 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  29.67 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  29.76 
 
 
115 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  28.26 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0419  hypothetical protein  29.49 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2621  hypothetical protein  28.89 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.249964  normal  0.209619 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  27.47 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  27.96 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0599  hypothetical protein  28.41 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.736189  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  24.18 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4004  protein of unknown function DUF1330  26.88 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  26.37 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  27.17 
 
 
96 aa  42  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  27.17 
 
 
96 aa  42  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06041  hypothetical protein  26.32 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.497862 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  27.47 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0668  protein of unknown function DUF1330  25.26 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0495537  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0432  hypothetical protein  28.92 
 
 
118 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0442  hypothetical protein  28.92 
 
 
118 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0183199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  35.85 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>