41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2179 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 		 291 aa  584  1e-166  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1053  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  77.39 
 
 		 299 aa  463  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3212  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  76.92 
 
 		 301 aa  457  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0262  hypothetical protein  75.27 
 
 		 289 aa  449  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.437952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1760  hypothetical protein  51.66 
 
 		 514 aa  270  1e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1131  hypothetical protein  44.24 
 
 		 253 aa  216  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.470289  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0274  hypothetical protein  41.18 
 
 		 479 aa  192  8e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3458  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1856  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.69 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.162981 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1731  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.59 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0681  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.65 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.513055  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0668  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.83 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.420308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1417  sirohydrochlorin cobaltochelatase  33.08 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.158753 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0518  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.01 
 
 		 143 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.176481  normal  0.663742 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1086  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.56 
 
 		 135 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2923  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.06 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0365477  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0104  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.54 
 
 		 129 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0307  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.68 
 
 		 121 aa  52.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.53 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0217  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.57 
 
 		 229 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.72457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1566  hypothetical protein  25.57 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0344  sirohydrochlorin cobaltochelatase  28.46 
 
 		 130 aa  49.7  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.922542 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1035  sirohydrochlorin cobaltochelatase  29.1 
 
 		 131 aa  49.7  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.137953  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3047  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.67 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3504  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.78 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0566  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.81 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119137 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1381  sirohydrochlorin cobaltochelatase  26.24 
 
 		 143 aa  47.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.109069  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2400  sirohydrochlorin cobaltochelatase  25.19 
 
 		 130 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5921  hypothetical protein  28.57 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1164  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.76 
 
 		 146 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.427239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1169  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.94 
 
 		 150 aa  45.8  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0657  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.71 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415953  normal  0.211128 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1002  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.72 
 
 		 122 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1785  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.1 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0615189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12790  hypothetical protein  26.52 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1832  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.78 
 
 		 116 aa  44.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.42293  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1511  sirohydrochlorin cobaltochelatase  31.76 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.629773  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0786  sirohydrochlorin cobaltochelatase  22.92 
 
 		 146 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3859  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.81 
 
 		 234 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72846  normal  0.0769538 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1890  putative secreted protein  26.72 
 
 		 255 aa  43.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28310  hypothetical protein  28.57 
 
 		 306 aa  42.4  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>