81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28310 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28310  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0657  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  50 
 
 		 230 aa  198  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415953  normal  0.211128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2795  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  50.83 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.048407  hitchhiker  0.00112635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1776  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  51.54 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.324205  normal  0.011171 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3126  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  46.35 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2821  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  43.51 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00171982 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2078  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  47.76 
 
 		 238 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00880  hypothetical protein  46.32 
 
 		 251 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1324  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  48.48 
 
 		 275 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215746  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1626  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.31 
 
 		 531 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3504  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  41.13 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10263  hypothetical protein  38.2 
 
 		 247 aa  123  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.826629  normal  0.120754 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.58 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09950  hypothetical protein  45.64 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18840  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.74 
 
 		 515 aa  119  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00867929  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0381  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.91 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00853901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5921  hypothetical protein  40.44 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0300  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.55 
 
 		 246 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.2 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  decreased coverage  0.000000457043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1890  putative secreted protein  40.5 
 
 		 255 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0272  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.73 
 
 		 231 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.243812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0262  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.73 
 
 		 231 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0841  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.53 
 
 		 252 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000619723  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0252  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.29 
 
 		 231 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1231  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  41.03 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1812  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  45.08 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2684  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.47 
 
 		 234 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.13 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1128  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.91 
 
 		 228 aa  99  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2348  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.4 
 
 		 247 aa  96.3  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.7 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882429 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12421  hypothetical protein  35.15 
 
 		 281 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6698  sirohydrochlorin cobaltochelatase  37.21 
 
 		 253 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99079  normal  0.371849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1785  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.49 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0615189  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2247  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.05 
 
 		 258 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.0131126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.19 
 
 		 234 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3539  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.19 
 
 		 234 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3489  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.19 
 
 		 234 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12790  hypothetical protein  33.6 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3859  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.48 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72846  normal  0.0769538 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2817  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.01 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4371  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.58 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3170  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.91 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.803624  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4082  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.29 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3702  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.54 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.512385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.04 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.98 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.43 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.31 
 
 		 553 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1096  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.43 
 
 		 127 aa  52.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  24.6 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3165  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.36 
 
 		 134 aa  49.3  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3165  cbiX domain protein  23.81 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  30.2 
 
 		 520 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2563  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.95 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.848204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2430  hypothetical protein  28.45 
 
 		 229 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1289  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.06 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0644  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.13 
 
 		 472 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1281  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.57 
 
 		 120 aa  46.2  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.967515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  23.21 
 
 		 236 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2421  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.93 
 
 		 258 aa  45.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0205  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  21.05 
 
 		 247 aa  45.8  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1946  hypothetical protein  20.83 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  25.5 
 
 		 534 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0104  sirohydrochlorin cobaltochelatase  32.47 
 
 		 129 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1417  sirohydrochlorin cobaltochelatase  23.39 
 
 		 133 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.158753 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1987  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.06 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1271  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.1 
 
 		 465 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2290  cbiX domain protein  20.83 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2124  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.12 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00535032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0297  hypothetical protein  31.12 
 
 		 225 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.625672 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07571  hypothetical protein  23.08 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.746447  hitchhiker  0.00609734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7366  putative transmembrane protein  25.99 
 
 		 275 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0247614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4925  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.59 
 
 		 127 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.15 
 
 		 291 aa  43.5  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1918  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.93 
 
 		 127 aa  42.7  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2903  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.43 
 
 		 132 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0344  sirohydrochlorin cobaltochelatase  24.03 
 
 		 130 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.922542 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0928  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.19 
 
 		 125 aa  42.4  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000175359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0565  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.13 
 
 		 471 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1035  sirohydrochlorin cobaltochelatase  25 
 
 		 131 aa  42.4  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.137953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>