159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0523 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0523  SAF domain-containing protein  100 
 
 
262 aa  520  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  40.5 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  37.26 
 
 
244 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2853  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.91 
 
 
252 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.765883  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0970  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.82 
 
 
233 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  34.29 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0940  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.95 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  37.39 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1175  SAF domain-containing protein  36.17 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  29.96 
 
 
243 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1795  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.77 
 
 
255 aa  96.3  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.2 
 
 
250 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.74 
 
 
232 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1318  flageller protein FlgA  31.75 
 
 
248 aa  92.4  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.47 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1926  flagellar protein, putative  33.33 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3487  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.88 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.38 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.460047  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.43 
 
 
250 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.8 
 
 
225 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32 
 
 
232 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06151  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.29 
 
 
214 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000222326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.29 
 
 
214 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0919764  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004176  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  29.36 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.29 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.669338  normal  0.182462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2950  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.92 
 
 
235 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.892014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2965  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.92 
 
 
235 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.639269  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1413  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.92 
 
 
235 aa  85.9  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000741  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  35.86 
 
 
265 aa  85.5  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.79 
 
 
232 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2600  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.5 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01281  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.06 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.25 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.5 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6372  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.29 
 
 
320 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682175  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.44 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3021  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.29 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2936  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.81 
 
 
418 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2925  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.79 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3071  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.33 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0228  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.72 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.531559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0718  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.72 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1540  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  27.69 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2412  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.33 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3026  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.33 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.124973  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.72 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1953  flageller protein FlgA  26.83 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1979  flageller protein FlgA  30.77 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0139  putative flagella basal body P-ring formation protein  28.11 
 
 
502 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  29.46 
 
 
281 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.81 
 
 
235 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3045  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.85 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.279341 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1067  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  33.56 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106649  normal  0.0500277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1318  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.81 
 
 
235 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212104 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1342  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.66 
 
 
235 aa  77  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.127049  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0748  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.32 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3733  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.54 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1337  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.74 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3845  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  35.34 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020675 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1948  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.3 
 
 
314 aa  75.5  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68378  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5624  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.26 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3795  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  27.7 
 
 
504 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1300  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.05 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3652  flageller protein FlgA  26.43 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2947  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.83 
 
 
424 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1594  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.86 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3761  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  34.59 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.417921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4105  SAF domain-containing protein  33.09 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3090  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.86 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1473  putative flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  24.68 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1256  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.41 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1326  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.41 
 
 
235 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0076  SAF domain-containing protein  33.71 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0070  SAF domain-containing protein  34.27 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3280  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.07 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  38.46 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3323  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.76 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1204  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.24 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2992  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.76 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2101  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.76 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0265  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.76 
 
 
509 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3050  flagella basal body P-ring formation protein flgA, putative  32.26 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3270  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  36 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132076  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02933  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.41 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2735  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.87 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000036483 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3469  SAF domain-containing protein  29.48 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1251  SAF domain-containing protein  28.24 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.792381  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1477  flageller protein FlgA  25 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3046  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  35.2 
 
 
348 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3244  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  35.48 
 
 
348 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1120  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.74 
 
 
380 aa  65.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3074  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  29.73 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0277  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.44 
 
 
507 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1682  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.6 
 
 
366 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3972  SAF domain-containing protein  29.48 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0461  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.44 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1158  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.35 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.623618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4670  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.94 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5511  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.07 
 
 
355 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0835333  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3788  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.6 
 
 
358 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.09068  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>