More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0409 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
412 aa  843    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.75 
 
 
412 aa  528  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.16 
 
 
414 aa  531  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.67 
 
 
414 aa  523  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  57.18 
 
 
406 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.02 
 
 
417 aa  489  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.93 
 
 
404 aa  478  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.2 
 
 
406 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.72 
 
 
406 aa  471  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  57.83 
 
 
434 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  52.48 
 
 
406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  52.48 
 
 
406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  52.48 
 
 
406 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  52.48 
 
 
406 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  52.48 
 
 
406 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  57.07 
 
 
414 aa  468  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.48 
 
 
406 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  52.23 
 
 
406 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  52.23 
 
 
406 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  52.23 
 
 
406 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  51.98 
 
 
406 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.34 
 
 
420 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  54.21 
 
 
408 aa  459  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.07 
 
 
425 aa  456  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  53.6 
 
 
420 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.21 
 
 
441 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.55 
 
 
420 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.37 
 
 
414 aa  455  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  50.62 
 
 
413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  54.96 
 
 
414 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.86 
 
 
413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.16 
 
 
442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  51.24 
 
 
417 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.16 
 
 
417 aa  451  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.86 
 
 
413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  55.16 
 
 
420 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.99 
 
 
419 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.74 
 
 
419 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  54.33 
 
 
424 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0407  cysteine desulphurases, SufS  55.81 
 
 
428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  51.44 
 
 
429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.35 
 
 
419 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.12 
 
 
409 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.58 
 
 
414 aa  443  1e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.56 
 
 
451 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  52.59 
 
 
423 aa  443  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  50.61 
 
 
420 aa  442  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.64 
 
 
414 aa  443  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  50.99 
 
 
417 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.35 
 
 
410 aa  439  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.4 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  52.62 
 
 
421 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  55.19 
 
 
426 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.89 
 
 
417 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.37 
 
 
414 aa  439  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  51.48 
 
 
417 aa  439  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.19 
 
 
411 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  55.28 
 
 
414 aa  440  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.98 
 
 
418 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.6 
 
 
434 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  52.74 
 
 
419 aa  435  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51 
 
 
412 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  48.64 
 
 
408 aa  436  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.01 
 
 
415 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  50.25 
 
 
416 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.72 
 
 
434 aa  434  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.44 
 
 
428 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.33 
 
 
429 aa  433  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00791  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  49.87 
 
 
425 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  50.51 
 
 
416 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.51 
 
 
421 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  50 
 
 
425 aa  430  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.79 
 
 
404 aa  429  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.28 
 
 
443 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.7 
 
 
414 aa  425  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.63 
 
 
404 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 
412 aa  427  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.49 
 
 
415 aa  427  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.74 
 
 
418 aa  425  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.49 
 
 
408 aa  422  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.73 
 
 
429 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  51.53 
 
 
405 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  52.23 
 
 
417 aa  424  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.99 
 
 
429 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  48.28 
 
 
410 aa  422  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.37 
 
 
414 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.99 
 
 
429 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.11 
 
 
406 aa  423  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.23 
 
 
414 aa  421  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  47.64 
 
 
419 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  47.78 
 
 
419 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.84 
 
 
435 aa  418  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  51.53 
 
 
405 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  50 
 
 
404 aa  417  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  49.63 
 
 
414 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  52.11 
 
 
422 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19482  cysteine desulfurase for iron-sulfur cluster formation suf  51.15 
 
 
496 aa  415  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.01 
 
 
407 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  51.11 
 
 
405 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.86 
 
 
415 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>