289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0322 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0322  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 		 155 aa  321  3e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.072258  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0683  rRNA large subunit methyltransferase  80.65 
 
 		 155 aa  269  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000302367  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0801  rRNA large subunit methyltransferase  80.65 
 
 		 155 aa  269  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000227115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0697  rRNA large subunit methyltransferase  80.65 
 
 		 155 aa  269  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00566103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0743  rRNA large subunit methyltransferase  80.65 
 
 		 155 aa  269  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000786877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0757  rRNA large subunit methyltransferase  80.65 
 
 		 155 aa  269  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00922876  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00605  hypothetical protein  80.65 
 
 		 155 aa  268  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2990  protein of unknown function DUF163  80.65 
 
 		 155 aa  268  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000047133  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0656  rRNA large subunit methyltransferase  80.65 
 
 		 155 aa  268  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000108281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0662  rRNA large subunit methyltransferase  80.65 
 
 		 155 aa  268  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000637947  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3009  rRNA large subunit methyltransferase  80.65 
 
 		 155 aa  268  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000239477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0725  rRNA large subunit methyltransferase  80.65 
 
 		 155 aa  268  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000708993  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00594  hypothetical protein  80.65 
 
 		 155 aa  268  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000243444  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0615  rRNA large subunit methyltransferase  80.65 
 
 		 155 aa  268  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121913  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0688  rRNA large subunit methyltransferase  80.65 
 
 		 155 aa  268  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000154252  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1171  rRNA large subunit methyltransferase  80 
 
 		 155 aa  267  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.195021  normal  0.132715 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2948  rRNA large subunit methyltransferase  80.77 
 
 		 156 aa  265  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0113814  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3020  rRNA large subunit methyltransferase  80.77 
 
 		 156 aa  265  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000384125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1847  rRNA large subunit methyltransferase  80.77 
 
 		 156 aa  265  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3149  rRNA large subunit methyltransferase  80.13 
 
 		 156 aa  265  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1182  rRNA large subunit methyltransferase  80.13 
 
 		 156 aa  265  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1202  hypothetical protein  80.13 
 
 		 156 aa  265  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2963  rRNA large subunit methyltransferase  78.85 
 
 		 156 aa  263  5.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1093  rRNA large subunit methyltransferase  77.56 
 
 		 156 aa  262  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0986  rRNA large subunit methyltransferase  76.92 
 
 		 156 aa  258  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  77.56 
 
 		 156 aa  256  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  76.28 
 
 		 156 aa  255  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0700  rRNA large subunit methyltransferase  75 
 
 		 156 aa  250  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000637083  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0856  rRNA large subunit methyltransferase  74.36 
 
 		 156 aa  249  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000031317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3707  rRNA large subunit methyltransferase  73.08 
 
 		 156 aa  246  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000116859  decreased coverage  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1169  rRNA large subunit methyltransferase  73.08 
 
 		 156 aa  245  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0992  rRNA large subunit methyltransferase  73.08 
 
 		 156 aa  244  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000354968  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0996  rRNA large subunit methyltransferase  73.08 
 
 		 156 aa  244  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000270066  normal  0.150944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  73.08 
 
 		 156 aa  245  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000227435  normal  0.158924 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3274  rRNA large subunit methyltransferase  73.08 
 
 		 156 aa  244  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1093  rRNA large subunit methyltransferase  73.08 
 
 		 156 aa  244  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000256643  hitchhiker  0.000000000516486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2868  rRNA large subunit methyltransferase  73.08 
 
 		 156 aa  244  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000163704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3452  rRNA large subunit methyltransferase  73.08 
 
 		 156 aa  244  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000535521  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3316  rRNA large subunit methyltransferase  73.08 
 
 		 156 aa  244  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  72.44 
 
 		 156 aa  243  6.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178909  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1057  rRNA large subunit methyltransferase  72.44 
 
 		 156 aa  243  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000490967  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3484  rRNA large subunit methyltransferase  72.44 
 
 		 156 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000336055  unclonable  0.0000000000393257 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3148  rRNA large subunit methyltransferase  71.79 
 
 		 156 aa  239  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000132782  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1561  rRNA large subunit methyltransferase  69.87 
 
 		 156 aa  236  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01658  rRNA large subunit methyltransferase  69.23 
 
 		 156 aa  233  7e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000106355  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004221  hypothetical protein  75.17 
 
 		 145 aa  232  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000988168  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1136  rRNA large subunit methyltransferase  69.23 
 
 		 156 aa  232  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00404994  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1716  rRNA large subunit methyltransferase  67.31 
 
 		 156 aa  231  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  60 
 
 		 155 aa  208  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  56.77 
 
 		 156 aa  206  9e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  57.42 
 
 		 155 aa  201  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  57.42 
 
 		 155 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  56.13 
 
 		 155 aa  201  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  57.42 
 
 		 155 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  57.42 
 
 		 155 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  56.13 
 
 		 155 aa  200  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  56.77 
 
 		 155 aa  200  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  56.77 
 
 		 155 aa  200  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  56.13 
 
 		 155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  55.48 
 
 		 155 aa  198  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  56.13 
 
 		 155 aa  197  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  53.9 
 
 		 155 aa  191  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  54.19 
 
 		 155 aa  187  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  54.49 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08380  rRNA large subunit methyltransferase  58.06 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0699075  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  53.55 
 
 		 156 aa  177  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  53.55 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  50.97 
 
 		 155 aa  175  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  52.9 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000386318  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  52.9 
 
 		 157 aa  167  6e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  52.9 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  48.12 
 
 		 162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  49.03 
 
 		 156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  49.03 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  47.74 
 
 		 156 aa  157  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  46.45 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  46.88 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  47.1 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  47.1 
 
 		 156 aa  153  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  47.1 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  46.45 
 
 		 156 aa  150  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  46.45 
 
 		 156 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  45.81 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  45.16 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  44.52 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  45.16 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  45.16 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  44.94 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1342  rRNA large subunit methyltransferase  44.87 
 
 		 156 aa  147  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  46.88 
 
 		 162 aa  146  8e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  47.59 
 
 		 145 aa  146  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  43.23 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>