95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4340 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  45.45 
 
 
2748 aa  1349    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  39.04 
 
 
2860 aa  1937    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  46.02 
 
 
2761 aa  1310    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  45.12 
 
 
2875 aa  1288    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  46.05 
 
 
2842 aa  1316    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  100 
 
 
3021 aa  6157    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  45.06 
 
 
2874 aa  1244    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  40.59 
 
 
2864 aa  1179    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  47.05 
 
 
2864 aa  1347    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  43.96 
 
 
1303 aa  1055    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  36.91 
 
 
2870 aa  1679    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  41.23 
 
 
2888 aa  1181    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  38.38 
 
 
2922 aa  2083    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  46.75 
 
 
2864 aa  1328    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  46.18 
 
 
2758 aa  1297    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  40.85 
 
 
2880 aa  2073    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  41.76 
 
 
2929 aa  2150    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  75.27 
 
 
2453 aa  3637    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  81.22 
 
 
624 aa  1066    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  40.24 
 
 
2839 aa  1137    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  39.59 
 
 
2730 aa  998    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  37.71 
 
 
2887 aa  2026    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  41.91 
 
 
2881 aa  2012    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  45.39 
 
 
2901 aa  1339    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  40.82 
 
 
2823 aa  1274    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  43.14 
 
 
2786 aa  1305    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  40.71 
 
 
2732 aa  1183    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  42.5 
 
 
2932 aa  2115    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  45.91 
 
 
2859 aa  1391    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  45.15 
 
 
2769 aa  1302    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  41.55 
 
 
2905 aa  2076    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  46.16 
 
 
2748 aa  1285    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  40.51 
 
 
2716 aa  1103    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  39.61 
 
 
2839 aa  1134    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  38.56 
 
 
2793 aa  999    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  40.46 
 
 
2833 aa  1139    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  39.02 
 
 
2868 aa  1860    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  45.72 
 
 
2845 aa  1359    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  45.12 
 
 
2868 aa  1277    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  41.71 
 
 
2916 aa  2135    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  46.08 
 
 
2747 aa  1340    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  45.18 
 
 
2831 aa  1281    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  39.82 
 
 
2779 aa  1040    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  39.56 
 
 
2731 aa  1014    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  35.1 
 
 
2884 aa  1636    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  39.85 
 
 
849 aa  532  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  35.6 
 
 
786 aa  506  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  32.89 
 
 
785 aa  362  4e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  30.82 
 
 
813 aa  360  2.9999999999999997e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  30.82 
 
 
813 aa  360  2.9999999999999997e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  30.33 
 
 
811 aa  360  2.9999999999999997e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  31.55 
 
 
784 aa  357  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  29.27 
 
 
822 aa  356  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  29.15 
 
 
784 aa  351  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  29.5 
 
 
811 aa  347  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  30.83 
 
 
815 aa  343  4e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  28.74 
 
 
790 aa  335  6e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  29.17 
 
 
811 aa  333  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  29.43 
 
 
819 aa  333  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  28.25 
 
 
801 aa  321  1e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  28.38 
 
 
811 aa  318  8e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  27.45 
 
 
802 aa  317  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  29.5 
 
 
797 aa  315  7.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  28.13 
 
 
811 aa  314  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  27.88 
 
 
831 aa  310  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  27.21 
 
 
802 aa  308  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  27.33 
 
 
815 aa  307  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  29.64 
 
 
822 aa  298  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  28.81 
 
 
794 aa  296  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  26.27 
 
 
824 aa  290  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  27.54 
 
 
829 aa  290  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  26.42 
 
 
809 aa  283  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  26.69 
 
 
762 aa  281  9e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  28.57 
 
 
827 aa  275  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  27.12 
 
 
796 aa  274  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  27.64 
 
 
823 aa  273  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  24.73 
 
 
797 aa  272  8e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  24.94 
 
 
797 aa  264  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  25.66 
 
 
788 aa  202  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  26.16 
 
 
801 aa  174  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  22.68 
 
 
802 aa  163  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  21.95 
 
 
984 aa  109  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  27.04 
 
 
1136 aa  76.3  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  20.17 
 
 
900 aa  75.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  22.61 
 
 
1113 aa  69.3  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  23.96 
 
 
536 aa  69.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  19.67 
 
 
904 aa  67.4  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  27.97 
 
 
536 aa  67  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  24.24 
 
 
1100 aa  64.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  24.84 
 
 
754 aa  60.1  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  22.89 
 
 
541 aa  59.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  23.98 
 
 
1145 aa  59.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3093  glucosyltransferase MdoH  29.35 
 
 
679 aa  54.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.277879  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  24.69 
 
 
1094 aa  50.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2792  glucosyltransferase MdoH  23.96 
 
 
641 aa  47  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>