More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2616 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 171 aa  343  6e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  81.87 
 
 		 171 aa  297  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  82.46 
 
 		 171 aa  296  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  84.21 
 
 		 171 aa  295  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  84.21 
 
 		 171 aa  294  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  81.29 
 
 		 172 aa  294  5e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  76.02 
 
 		 171 aa  278  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  73.1 
 
 		 178 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  54.97 
 
 		 176 aa  194  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 		 173 aa  192  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  57.83 
 
 		 172 aa  191  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 		 182 aa  191  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  55 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  54.04 
 
 		 179 aa  187  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 181 aa  187  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 		 181 aa  187  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 		 173 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 		 181 aa  187  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 		 181 aa  187  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 		 181 aa  187  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 		 181 aa  187  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  53.05 
 
 		 181 aa  186  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 		 172 aa  186  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  52.8 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 		 170 aa  184  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0751  adenine phosphoribosyltransferase  54.39 
 
 		 172 aa  184  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48734  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 		 174 aa  184  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0802  adenine phosphoribosyltransferase  54.39 
 
 		 172 aa  184  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0798  adenine phosphoribosyltransferase  54.39 
 
 		 172 aa  184  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0128483  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 		 172 aa  182  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 		 172 aa  181  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 187 aa  181  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 187 aa  181  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 187 aa  180  7e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  51.48 
 
 		 170 aa  180  9.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 182 aa  179  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 		 181 aa  179  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 174 aa  177  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 181 aa  177  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 170 aa  177  7e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 		 173 aa  177  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 		 171 aa  177  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 		 180 aa  176  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 183 aa  176  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  51.48 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 		 181 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 		 184 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 		 184 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  50.62 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 		 184 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 		 184 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 180 aa  175  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 185 aa  175  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 		 199 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  50.29 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 		 184 aa  174  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 214 aa  174  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 170 aa  174  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 		 181 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 		 182 aa  174  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 		 183 aa  174  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 		 183 aa  174  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 		 172 aa  174  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 		 185 aa  174  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 		 181 aa  173  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 		 185 aa  173  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  52.6 
 
 		 173 aa  173  9e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 		 172 aa  172  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 183 aa  173  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  55 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  51.27 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  52.83 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1626  adenine phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 		 181 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0996441  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 		 177 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 		 181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_004310  BR1540  adenine phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 		 186 aa  170  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1489  adenine phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 		 181 aa  170  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>