More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5079 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_5079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
487 aa  960    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4223  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  63.81 
 
 
486 aa  590  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  63.67 
 
 
523 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  63.45 
 
 
491 aa  578  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  65.74 
 
 
502 aa  579  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5397  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  65.32 
 
 
464 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4840  tRNA adenylyltransferase  63.71 
 
 
489 aa  568  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305864  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  62.07 
 
 
480 aa  569  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6061  metal dependent phosphohydrolase  63.75 
 
 
483 aa  559  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  61.51 
 
 
485 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0845  metal dependent phosphohydrolase  63.27 
 
 
497 aa  557  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325439  normal  0.188962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5773  metal dependent phosphohydrolase  64.27 
 
 
489 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.626419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  61.09 
 
 
485 aa  555  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5486  metal dependent phosphohydrolase  64.27 
 
 
489 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.527547  normal  0.550288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5397  metal dependent phosphohydrolase  64.73 
 
 
455 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517114  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26890  tRNA adenylyltransferase  60.7 
 
 
484 aa  552  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  60.17 
 
 
502 aa  544  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  61.64 
 
 
483 aa  530  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  60.41 
 
 
490 aa  531  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  58.55 
 
 
473 aa  526  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  57.71 
 
 
499 aa  511  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3362  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  58.01 
 
 
500 aa  512  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7321  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  57.76 
 
 
508 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  59.03 
 
 
483 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3712  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  58.87 
 
 
507 aa  505  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4494  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  59.34 
 
 
508 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0150465  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  55.05 
 
 
496 aa  500  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  57.08 
 
 
479 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  56.26 
 
 
552 aa  496  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  59.12 
 
 
525 aa  496  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  56.42 
 
 
471 aa  491  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4681  HDIG domain-containing protein  57.11 
 
 
483 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37890  tRNA adenylyltransferase  56.46 
 
 
488 aa  488  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3924  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  53.88 
 
 
502 aa  487  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  58.64 
 
 
483 aa  480  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2542  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  53.56 
 
 
492 aa  472  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  52.01 
 
 
471 aa  458  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  50.21 
 
 
475 aa  444  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  47.54 
 
 
462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.96 
 
 
484 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2803  polynucleotide adenylyltransferase region  38.68 
 
 
510 aa  264  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.1 
 
 
471 aa  253  7e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.76 
 
 
489 aa  242  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  35.54 
 
 
476 aa  239  6.999999999999999e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
471 aa  237  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  33.75 
 
 
477 aa  237  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  34.89 
 
 
474 aa  233  6e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34 
 
 
475 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  37.06 
 
 
448 aa  228  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  33.05 
 
 
470 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.27 
 
 
483 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.55 
 
 
479 aa  228  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.4 
 
 
469 aa  226  6e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.47 
 
 
561 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.95 
 
 
468 aa  224  3e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 
495 aa  223  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  33.48 
 
 
475 aa  222  9e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.6 
 
 
484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  32.81 
 
 
479 aa  215  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.49 
 
 
450 aa  210  4e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 
464 aa  207  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.97 
 
 
448 aa  207  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  33.26 
 
 
483 aa  204  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
459 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 
442 aa  195  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.26 
 
 
464 aa  189  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.24 
 
 
473 aa  176  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  37.16 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  31.81 
 
 
454 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  33.04 
 
 
451 aa  171  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.45 
 
 
427 aa  171  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.18 
 
 
465 aa  167  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  37.61 
 
 
394 aa  160  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.15 
 
 
584 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
583 aa  152  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  32.07 
 
 
492 aa  151  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1813  tRNA nucleotidyltransferase (CCA-adding enzyme)  28.38 
 
 
437 aa  150  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  40.95 
 
 
401 aa  147  6e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  25.85 
 
 
424 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  25.85 
 
 
422 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  34.14 
 
 
436 aa  140  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.87 
 
 
398 aa  137  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1889  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.18 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2387  tRNA cytidylyltransferase  34.68 
 
 
436 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0216975  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.73 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1012  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  34.01 
 
 
399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.200696  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  39.04 
 
 
404 aa  127  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  32.64 
 
 
434 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1480  polynucleotide adenylyltransferase region  32.33 
 
 
436 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.846111  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0240  metal dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 
416 aa  126  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000820845  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  32.8 
 
 
471 aa  123  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.5 
 
 
402 aa  123  7e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0218  polyA polymerase family protein  31.22 
 
 
456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0396  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.22 
 
 
456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.220421 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08990  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  29.86 
 
 
467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0264  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.28 
 
 
517 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2216  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 
426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.71 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.73 
 
 
404 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0883  Poly(A) polymerase, PcnB  31.12 
 
 
401 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0632296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>