77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2728 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2728  protein of unknown function DUF881  100 
 
 
309 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  49.51 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  44.44 
 
 
270 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  44.44 
 
 
270 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  44.44 
 
 
270 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3404  hypothetical protein  46.75 
 
 
254 aa  166  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227023  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1737  protein of unknown function DUF881  37.09 
 
 
383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.588526  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3137  hypothetical protein  45.97 
 
 
254 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428458  normal  0.0440298 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  44.44 
 
 
292 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2522  hypothetical protein  47.93 
 
 
309 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2384  hypothetical protein  46.78 
 
 
305 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18250  hypothetical protein  39.21 
 
 
436 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3098  protein of unknown function DUF881  44.08 
 
 
258 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2103  protein of unknown function DUF881  38.66 
 
 
246 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1887  protein of unknown function DUF881  40.93 
 
 
388 aa  139  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.201634 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1303  protein of unknown function DUF881  36.65 
 
 
333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.412447  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4999  hypothetical protein  39.17 
 
 
283 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1228  hypothetical protein  35.86 
 
 
271 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.861927  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0474  hypothetical protein  31.22 
 
 
273 aa  124  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.166474  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1466  hypothetical protein  36.96 
 
 
296 aa  122  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15510  hypothetical protein  40 
 
 
250 aa  119  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3126  protein of unknown function DUF881  40.59 
 
 
571 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0799  hypothetical protein  30.74 
 
 
278 aa  109  6e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2715  hypothetical protein  38.28 
 
 
245 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0632611  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14990  hypothetical protein  42.01 
 
 
248 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  0.621189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  27.27 
 
 
240 aa  97.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  27.97 
 
 
245 aa  87  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  30.6 
 
 
230 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  24.67 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  30.26 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  28.02 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  26.72 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2282  hypothetical protein  29.05 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0713183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  22.32 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  27.27 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  67  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  31.03 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  30.39 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  25.22 
 
 
234 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  26.25 
 
 
242 aa  63.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  25 
 
 
244 aa  62.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  32.24 
 
 
315 aa  61.6  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  24.34 
 
 
243 aa  60.1  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18230  hypothetical protein  31.37 
 
 
288 aa  60.5  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509539  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  23.98 
 
 
243 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2105  protein of unknown function DUF881  34.68 
 
 
273 aa  56.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0148  protein of unknown function DUF881  29.79 
 
 
230 aa  56.2  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0476  hypothetical protein  28.85 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.75906  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0570  protein of unknown function DUF881  26.32 
 
 
236 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  30.81 
 
 
286 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  25.83 
 
 
238 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1305  protein of unknown function DUF881  36.36 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.498875  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2111  hypothetical protein  22.01 
 
 
238 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  24.63 
 
 
234 aa  52.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  29.52 
 
 
243 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  21.72 
 
 
243 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1825  hypothetical protein  20.91 
 
 
238 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0612463  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0801  hypothetical protein  27.85 
 
 
349 aa  49.7  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0026  protein of unknown function DUF881  33.85 
 
 
249 aa  49.3  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131728  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2322  aminodeoxychorismate lyase  53.7 
 
 
587 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284127  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2730  protein of unknown function DUF881  28.57 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242021  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.69 
 
 
1435 aa  47  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1735  protein of unknown function DUF881  31.9 
 
 
290 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.980276  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11853  hypothetical protein  28.23 
 
 
307 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  30.99 
 
 
301 aa  46.2  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2524  hypothetical protein  33.58 
 
 
316 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0147  protein of unknown function DUF881  22.61 
 
 
236 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  24.73 
 
 
263 aa  46.2  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  26.7 
 
 
250 aa  45.8  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  26.83 
 
 
253 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0022  protein of unknown function DUF881  34.65 
 
 
243 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3406  hypothetical protein  32.23 
 
 
296 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0021  protein of unknown function DUF881  25.77 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3139  hypothetical protein  27.27 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  27.88 
 
 
278 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  27.88 
 
 
278 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  27.88 
 
 
278 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>