62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2522 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2522  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2384  hypothetical protein  84.57 
 
 
305 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2728  protein of unknown function DUF881  48.23 
 
 
309 aa  159  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18250  hypothetical protein  41.56 
 
 
436 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  44.86 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1737  protein of unknown function DUF881  37.41 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.588526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1887  protein of unknown function DUF881  41.15 
 
 
388 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.201634 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1228  hypothetical protein  37.04 
 
 
271 aa  133  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.861927  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4999  hypothetical protein  38.81 
 
 
283 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  36.32 
 
 
292 aa  122  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  35.18 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  35.18 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  35.18 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2103  protein of unknown function DUF881  37.09 
 
 
246 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3137  hypothetical protein  35.51 
 
 
254 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428458  normal  0.0440298 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3098  protein of unknown function DUF881  42.01 
 
 
258 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3404  hypothetical protein  35.81 
 
 
254 aa  116  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227023  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1303  protein of unknown function DUF881  37.5 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.412447  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14990  hypothetical protein  40.54 
 
 
248 aa  112  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  0.621189 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15510  hypothetical protein  37.75 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1466  hypothetical protein  34.19 
 
 
296 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3126  protein of unknown function DUF881  38.55 
 
 
571 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2715  hypothetical protein  36.11 
 
 
245 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0632611  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0474  hypothetical protein  28.19 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.166474  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0799  hypothetical protein  29.02 
 
 
278 aa  93.6  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  29.66 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  34.03 
 
 
234 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  32.47 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  26.97 
 
 
245 aa  77  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  27.75 
 
 
240 aa  77  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  24.59 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  31.16 
 
 
234 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  24.51 
 
 
243 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  27.44 
 
 
242 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2282  hypothetical protein  26.43 
 
 
235 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0713183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  26.74 
 
 
233 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  32.35 
 
 
238 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  23.88 
 
 
247 aa  62.8  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  28.99 
 
 
234 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  23.53 
 
 
243 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  28.57 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  27.9 
 
 
243 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  26.61 
 
 
234 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  24.55 
 
 
235 aa  59.7  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  28.06 
 
 
233 aa  59.3  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  29.07 
 
 
244 aa  56.6  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0021  protein of unknown function DUF881  27.2 
 
 
280 aa  49.7  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  28.37 
 
 
286 aa  49.7  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  27.91 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  22.52 
 
 
243 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  27.91 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  27.91 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0014  protein of unknown function DUF881  29.87 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0570  protein of unknown function DUF881  26.54 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1025  protein of unknown function DUF881  28.42 
 
 
239 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540335  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  28.24 
 
 
253 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  26.53 
 
 
250 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0147  protein of unknown function DUF881  24.34 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  25.91 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0020  hypothetical protein  26.27 
 
 
272 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.987463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0072  protein of unknown function DUF881  29.63 
 
 
242 aa  43.5  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0021  hypothetical protein  28.44 
 
 
273 aa  42.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>