87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0799 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0799  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  574  1.0000000000000001e-163  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0474  hypothetical protein  50.73 
 
 
273 aa  293  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.166474  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18250  hypothetical protein  34.6 
 
 
436 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1737  protein of unknown function DUF881  29.86 
 
 
383 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.588526  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2103  protein of unknown function DUF881  36.71 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  30.32 
 
 
292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1887  protein of unknown function DUF881  34.4 
 
 
388 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.201634 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1303  protein of unknown function DUF881  36.51 
 
 
333 aa  117  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.412447  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  31.92 
 
 
270 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  31.92 
 
 
270 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  31.92 
 
 
270 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2728  protein of unknown function DUF881  32.73 
 
 
309 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15510  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1228  hypothetical protein  29.46 
 
 
271 aa  102  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.861927  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1466  hypothetical protein  29.55 
 
 
296 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  29.44 
 
 
245 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2384  hypothetical protein  30.8 
 
 
305 aa  99.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  30.29 
 
 
255 aa  99  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4999  hypothetical protein  29.88 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14990  hypothetical protein  35.79 
 
 
248 aa  95.5  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  0.621189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3098  protein of unknown function DUF881  30.84 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3137  hypothetical protein  30.81 
 
 
254 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428458  normal  0.0440298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3404  hypothetical protein  30.09 
 
 
254 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227023  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2522  hypothetical protein  28.37 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3126  protein of unknown function DUF881  31.05 
 
 
571 aa  82.4  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  25.97 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  30 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0570  protein of unknown function DUF881  25.58 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  25.65 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  26.2 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  27.04 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  24.1 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  24.87 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  28.14 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2105  protein of unknown function DUF881  27.68 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2715  hypothetical protein  28.91 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2282  hypothetical protein  25.93 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0713183  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  25.79 
 
 
234 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  27.37 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  27.18 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0052  hypothetical protein  22.55 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274482  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  26.03 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  28.11 
 
 
230 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  22.27 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  27.27 
 
 
238 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  25.84 
 
 
234 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1305  protein of unknown function DUF881  29.2 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.498875  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11853  hypothetical protein  24.51 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2879  hypothetical protein  25 
 
 
304 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2892  hypothetical protein  25 
 
 
304 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.619599  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2848  hypothetical protein  25 
 
 
304 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  23.74 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0021  hypothetical protein  22.03 
 
 
273 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18230  hypothetical protein  23.37 
 
 
288 aa  52.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509539  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0014  protein of unknown function DUF881  27.21 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  24.62 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  24.52 
 
 
242 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  20.32 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  21.21 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  21.58 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  22.73 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  25 
 
 
234 aa  49.7  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1825  hypothetical protein  21.32 
 
 
238 aa  48.9  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0612463  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3406  hypothetical protein  26.09 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  24.26 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1735  protein of unknown function DUF881  26.62 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.980276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3123  protein of unknown function DUF881  32.18 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0022  protein of unknown function DUF881  26.45 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1076  hypothetical protein  25.81 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0476  hypothetical protein  22.22 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.75906  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1386  hypothetical protein  24.04 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00318701  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  21.89 
 
 
278 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  21.89 
 
 
278 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  21.89 
 
 
278 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0020  hypothetical protein  22.51 
 
 
272 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.987463 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2111  hypothetical protein  20.66 
 
 
238 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3139  hypothetical protein  25.71 
 
 
297 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5001  hypothetical protein  25.47 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0147  protein of unknown function DUF881  23.27 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0021  protein of unknown function DUF881  23.4 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3100  protein of unknown function DUF881  32.31 
 
 
290 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  24.66 
 
 
250 aa  43.5  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2283  hypothetical protein  24.1 
 
 
249 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0076216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  20.72 
 
 
253 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  23.31 
 
 
301 aa  42.7  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0057  hypothetical protein  29.01 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.573043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4014  protein of unknown function DUF881  39.29 
 
 
299 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.207381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>