63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4999 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4999  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  530  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1466  hypothetical protein  54.94 
 
 
296 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  42.86 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1737  protein of unknown function DUF881  35.19 
 
 
383 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.588526  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1228  hypothetical protein  37.71 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.861927  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2728  protein of unknown function DUF881  39.17 
 
 
309 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  37.12 
 
 
292 aa  125  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1887  protein of unknown function DUF881  38.64 
 
 
388 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.201634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18250  hypothetical protein  36.56 
 
 
436 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2384  hypothetical protein  39.24 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2522  hypothetical protein  39.53 
 
 
309 aa  119  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3126  protein of unknown function DUF881  37.31 
 
 
571 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  36.04 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  36.04 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  36.04 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3137  hypothetical protein  38.32 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428458  normal  0.0440298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2103  protein of unknown function DUF881  36.54 
 
 
246 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3098  protein of unknown function DUF881  40.64 
 
 
258 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3404  hypothetical protein  36.74 
 
 
254 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227023  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15510  hypothetical protein  36.76 
 
 
250 aa  105  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0474  hypothetical protein  32.31 
 
 
273 aa  104  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.166474  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14990  hypothetical protein  39.36 
 
 
248 aa  102  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  0.621189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2715  hypothetical protein  37.74 
 
 
245 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0632611  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0799  hypothetical protein  29.88 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1303  protein of unknown function DUF881  33.68 
 
 
333 aa  96.7  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.412447  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  30 
 
 
240 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  34.23 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  28.21 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  26.87 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  26.8 
 
 
247 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  28.5 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  24.89 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2282  hypothetical protein  27.4 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0713183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  30.67 
 
 
230 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  24.03 
 
 
243 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  27.01 
 
 
235 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  20.98 
 
 
243 aa  62.4  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  30.57 
 
 
234 aa  62  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  26.5 
 
 
238 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  26.73 
 
 
234 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  24.44 
 
 
239 aa  60.1  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  27.88 
 
 
242 aa  58.9  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1076  hypothetical protein  22.37 
 
 
237 aa  56.2  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  21.05 
 
 
243 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  21.05 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  23.61 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  31.94 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2111  hypothetical protein  22.63 
 
 
238 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  28.92 
 
 
244 aa  52.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  25.84 
 
 
234 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0021  hypothetical protein  27.8 
 
 
273 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1825  hypothetical protein  21.05 
 
 
238 aa  49.3  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0612463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0148  protein of unknown function DUF881  27.62 
 
 
230 aa  48.9  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  32.82 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11853  hypothetical protein  28.76 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  28.57 
 
 
278 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  28.57 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  28.57 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10012  hypothetical protein  28.03 
 
 
262 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  29.29 
 
 
246 aa  45.8  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0570  protein of unknown function DUF881  27.47 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3123  protein of unknown function DUF881  35.19 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  30.83 
 
 
263 aa  42.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>