61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1303 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1303  protein of unknown function DUF881  100 
 
 
333 aa  655    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.412447  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18250  hypothetical protein  55.9 
 
 
436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1737  protein of unknown function DUF881  47.08 
 
 
383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.588526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1887  protein of unknown function DUF881  48.5 
 
 
388 aa  202  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.201634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2103  protein of unknown function DUF881  44.64 
 
 
246 aa  172  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  44.02 
 
 
255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3126  protein of unknown function DUF881  40.41 
 
 
571 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0474  hypothetical protein  36.48 
 
 
273 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.166474  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2728  protein of unknown function DUF881  37.38 
 
 
309 aa  135  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3098  protein of unknown function DUF881  42.49 
 
 
258 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0799  hypothetical protein  34.22 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15510  hypothetical protein  40.91 
 
 
250 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  36.51 
 
 
270 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  36.51 
 
 
270 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  36.51 
 
 
270 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1228  hypothetical protein  33.61 
 
 
271 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.861927  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2384  hypothetical protein  37.72 
 
 
305 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2522  hypothetical protein  37.26 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3404  hypothetical protein  36.05 
 
 
254 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227023  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  32.82 
 
 
292 aa  119  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3137  hypothetical protein  34.8 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428458  normal  0.0440298 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2715  hypothetical protein  35.98 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4999  hypothetical protein  33.03 
 
 
283 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14990  hypothetical protein  37.5 
 
 
248 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  0.621189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1466  hypothetical protein  33.48 
 
 
296 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  31.36 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  27.98 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  31.2 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  28.83 
 
 
247 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  30.87 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  30.81 
 
 
234 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  28.57 
 
 
235 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  29.28 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2282  hypothetical protein  29.06 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0713183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  27.04 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  34.53 
 
 
233 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  34.57 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  31.02 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  35.29 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  30.67 
 
 
286 aa  63.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  23.38 
 
 
243 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1305  protein of unknown function DUF881  39.8 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.498875  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  23.12 
 
 
243 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  25.64 
 
 
244 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  26.38 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  28.49 
 
 
215 aa  56.2  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  28.44 
 
 
243 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  25.47 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  28.57 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2105  protein of unknown function DUF881  31.93 
 
 
273 aa  50.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2111  hypothetical protein  20.2 
 
 
238 aa  49.3  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  32.82 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  33.67 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1825  hypothetical protein  19.7 
 
 
238 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0612463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3123  protein of unknown function DUF881  25.95 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0148  protein of unknown function DUF881  27.93 
 
 
230 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0570  protein of unknown function DUF881  24.88 
 
 
236 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2524  hypothetical protein  34.09 
 
 
316 aa  43.5  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0147  protein of unknown function DUF881  22.22 
 
 
236 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2283  hypothetical protein  26.06 
 
 
249 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0076216  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0021  hypothetical protein  24.74 
 
 
273 aa  42.7  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>