67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3404 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3404  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227023  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3137  hypothetical protein  86.56 
 
 
254 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428458  normal  0.0440298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  74.9 
 
 
270 aa  361  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  74.9 
 
 
270 aa  361  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  74.9 
 
 
270 aa  361  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  66.92 
 
 
292 aa  332  5e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  49.3 
 
 
255 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2728  protein of unknown function DUF881  46.61 
 
 
309 aa  174  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1228  hypothetical protein  38.4 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.861927  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1737  protein of unknown function DUF881  37.3 
 
 
383 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.588526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1887  protein of unknown function DUF881  42.65 
 
 
388 aa  129  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.201634 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15510  hypothetical protein  40.74 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2103  protein of unknown function DUF881  36.74 
 
 
246 aa  125  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2384  hypothetical protein  37.29 
 
 
305 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4999  hypothetical protein  36.29 
 
 
283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2522  hypothetical protein  35.78 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1303  protein of unknown function DUF881  37 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.412447  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1466  hypothetical protein  37.86 
 
 
296 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18250  hypothetical protein  33.04 
 
 
436 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  29.88 
 
 
245 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0799  hypothetical protein  30.51 
 
 
278 aa  106  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3098  protein of unknown function DUF881  35.27 
 
 
258 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0474  hypothetical protein  30.47 
 
 
273 aa  102  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.166474  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2715  hypothetical protein  34.26 
 
 
245 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0632611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  27.98 
 
 
240 aa  92.8  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  28.51 
 
 
239 aa  89.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  27.85 
 
 
247 aa  86.3  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  32.03 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3126  protein of unknown function DUF881  33.01 
 
 
571 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14990  hypothetical protein  34.95 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  0.621189 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  28.57 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  27.57 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  29.32 
 
 
215 aa  79  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  25.42 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  27 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0570  protein of unknown function DUF881  28.89 
 
 
236 aa  72  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  27.32 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  25.6 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  24.29 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  27.35 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2282  hypothetical protein  25.55 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0713183  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  26.63 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  22.97 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  31.61 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  29.96 
 
 
315 aa  58.9  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  22.94 
 
 
234 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  28.24 
 
 
234 aa  55.8  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11853  hypothetical protein  31.17 
 
 
307 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  20.56 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2111  hypothetical protein  19.91 
 
 
238 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1735  protein of unknown function DUF881  29.06 
 
 
290 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.980276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  20.08 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1825  hypothetical protein  19.31 
 
 
238 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0612463  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0022  protein of unknown function DUF881  30.77 
 
 
243 aa  49.3  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0148  protein of unknown function DUF881  25.13 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2283  hypothetical protein  24.87 
 
 
249 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0076216  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2105  protein of unknown function DUF881  28.02 
 
 
273 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  28.4 
 
 
250 aa  45.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3406  hypothetical protein  27.33 
 
 
296 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  24.55 
 
 
253 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0026  protein of unknown function DUF881  31.25 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131728  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  29.68 
 
 
301 aa  43.5  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  27.96 
 
 
263 aa  43.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  22.89 
 
 
243 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3139  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12540  hypothetical protein  26.14 
 
 
331 aa  42.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0147  protein of unknown function DUF881  22.8 
 
 
236 aa  42.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>