84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2715 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2715  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0632611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1737  protein of unknown function DUF881  40 
 
 
383 aa  145  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.588526  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  37.19 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  37.19 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  37.19 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2728  protein of unknown function DUF881  38.07 
 
 
309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1887  protein of unknown function DUF881  36.86 
 
 
388 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.201634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  37.71 
 
 
292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4999  hypothetical protein  38.91 
 
 
283 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18250  hypothetical protein  35.06 
 
 
436 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2103  protein of unknown function DUF881  40.54 
 
 
246 aa  118  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2522  hypothetical protein  36.11 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1228  hypothetical protein  34.44 
 
 
271 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.861927  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2384  hypothetical protein  35.44 
 
 
305 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  36.54 
 
 
255 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1466  hypothetical protein  36.02 
 
 
296 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3098  protein of unknown function DUF881  39.91 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1303  protein of unknown function DUF881  36.32 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.412447  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3137  hypothetical protein  34.76 
 
 
254 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428458  normal  0.0440298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3404  hypothetical protein  34.12 
 
 
254 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227023  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3126  protein of unknown function DUF881  38.82 
 
 
571 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15510  hypothetical protein  32.76 
 
 
250 aa  89  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0474  hypothetical protein  27.97 
 
 
273 aa  89  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.166474  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0799  hypothetical protein  29.09 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14990  hypothetical protein  35.14 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  0.621189 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  31.68 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  28.15 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  32.72 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  30.05 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2282  hypothetical protein  25.85 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0713183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  29.47 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  33.33 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  29.67 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  31.25 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  27.96 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  28.96 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  37.69 
 
 
301 aa  62.8  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  23.73 
 
 
239 aa  62  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  36.49 
 
 
286 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  28.7 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3123  protein of unknown function DUF881  35.82 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  26.58 
 
 
233 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  27.72 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2283  hypothetical protein  26.58 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0076216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  30.16 
 
 
233 aa  55.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11853  hypothetical protein  31.29 
 
 
307 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  34.97 
 
 
306 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  31.61 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12540  hypothetical protein  28.23 
 
 
331 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  27.53 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  28.48 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0167  protein of unknown function DUF881  29.73 
 
 
253 aa  52.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.942049  normal  0.647694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0020  hypothetical protein  28.67 
 
 
272 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.987463 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1305  protein of unknown function DUF881  30 
 
 
286 aa  52  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.498875  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10012  hypothetical protein  30.99 
 
 
262 aa  52  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  23.44 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  26.21 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5001  hypothetical protein  33.57 
 
 
297 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  23.46 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  21.95 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0072  protein of unknown function DUF881  30.47 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0147  protein of unknown function DUF881  28.3 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  29.53 
 
 
278 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  32.79 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0014  protein of unknown function DUF881  35.05 
 
 
257 aa  49.3  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  29.53 
 
 
278 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3406  hypothetical protein  36.04 
 
 
296 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3139  hypothetical protein  35.24 
 
 
297 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  29.86 
 
 
278 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2730  protein of unknown function DUF881  29.24 
 
 
306 aa  48.5  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242021  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0021  hypothetical protein  28.25 
 
 
273 aa  48.5  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0022  protein of unknown function DUF881  34.09 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  30.08 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2892  hypothetical protein  33.66 
 
 
304 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.619599  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2848  hypothetical protein  33.66 
 
 
304 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2879  hypothetical protein  33.66 
 
 
304 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0042  protein of unknown function DUF881  28.4 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0570  protein of unknown function DUF881  27.72 
 
 
236 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0476  hypothetical protein  34.04 
 
 
325 aa  43.5  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.75906  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0033  protein of unknown function DUF881  25 
 
 
255 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.249833  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4014  protein of unknown function DUF881  34.83 
 
 
299 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  26.88 
 
 
246 aa  42.7  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0148  protein of unknown function DUF881  40 
 
 
230 aa  42.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1076  hypothetical protein  26.13 
 
 
237 aa  41.6  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>