90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0021 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0021  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  545  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  42.97 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0042  protein of unknown function DUF881  35.63 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0033  protein of unknown function DUF881  36.29 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.249833  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0021  protein of unknown function DUF881  40.35 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0026  protein of unknown function DUF881  37.71 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131728  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0072  protein of unknown function DUF881  34.58 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0052  hypothetical protein  36.69 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  35.62 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27030  hypothetical protein  30.99 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99659  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00170  hypothetical protein  36.02 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0524836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  33.59 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0014  protein of unknown function DUF881  36.16 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0020  hypothetical protein  34.39 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987463 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0022  protein of unknown function DUF881  37.05 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0167  protein of unknown function DUF881  33.91 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.942049  normal  0.647694 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0028  hypothetical protein  32.1 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1386  hypothetical protein  32.93 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00318701  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10012  hypothetical protein  32.11 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0057  hypothetical protein  35.27 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.573043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4438  hypothetical protein  37.18 
 
 		 329 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.226653  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  31.07 
 
 		 240 aa  95.9  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  27.89 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0132  hypothetical protein  38.12 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0808473  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  27.31 
 
 		 247 aa  92.8  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0147  protein of unknown function DUF881  33.68 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  28.37 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  27.88 
 
 		 243 aa  85.9  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  24.89 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  34.11 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2283  hypothetical protein  26.98 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0076216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  30.26 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  30.05 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1735  protein of unknown function DUF881  38.96 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.980276  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  31.3 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3100  protein of unknown function DUF881  43.62 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  35 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1076  hypothetical protein  28.07 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  28.39 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  30 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1305  protein of unknown function DUF881  28.04 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.498875  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  27.1 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2730  protein of unknown function DUF881  46.53 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242021  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  29.94 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  27.85 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  30.71 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  29.5 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  43.62 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  26.02 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2105  protein of unknown function DUF881  27.94 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0801  hypothetical protein  27.6 
 
 		 349 aa  65.5  0.0000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  26.67 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2524  hypothetical protein  30.95 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12540  hypothetical protein  31.58 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11853  hypothetical protein  28.5 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2386  hypothetical protein  31.33 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18230  hypothetical protein  34 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509539  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3123  protein of unknown function DUF881  34.38 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  32.89 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  26.95 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4014  protein of unknown function DUF881  29.81 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3406  hypothetical protein  31.48 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0476  hypothetical protein  25.41 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.75906  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0799  hypothetical protein  22.03 
 
 		 278 aa  53.1  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  27.43 
 
 		 233 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  30.41 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15510  hypothetical protein  28.86 
 
 		 250 aa  52.4  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2879  hypothetical protein  27.52 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2848  hypothetical protein  27.52 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1464  hypothetical protein  29.89 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.420029  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2892  hypothetical protein  27.52 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.619599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0474  hypothetical protein  19.81 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.166474  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3139  hypothetical protein  30.63 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0148  protein of unknown function DUF881  28.93 
 
 		 230 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5001  hypothetical protein  34.41 
 
 		 297 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4999  hypothetical protein  27.8 
 
 		 283 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  27.16 
 
 		 242 aa  48.9  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14990  hypothetical protein  30.25 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  0.621189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3098  protein of unknown function DUF881  29.14 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1887  protein of unknown function DUF881  26.7 
 
 		 388 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.201634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  27.09 
 
 		 270 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  27.09 
 
 		 270 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  27.09 
 
 		 270 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15010  hypothetical protein  37.04 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290964  normal  0.849672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2282  hypothetical protein  26.38 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0713183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0570  protein of unknown function DUF881  26.15 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>