67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2111 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2111  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  471  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1825  hypothetical protein  97.06 
 
 
238 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0612463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  30.54 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  29.22 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  30.3 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  27.71 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0148  protein of unknown function DUF881  30.2 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  29.73 
 
 
233 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  24.58 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  26.96 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  26.05 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  28.64 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0570  protein of unknown function DUF881  26.34 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  26.67 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  23.48 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  22.92 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0474  hypothetical protein  26.03 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.166474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  30 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  25.42 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  23.73 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0801  hypothetical protein  27.32 
 
 
349 aa  63.2  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  24.05 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1737  protein of unknown function DUF881  23.42 
 
 
383 aa  62.4  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.588526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  25.73 
 
 
243 aa  62  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  30.21 
 
 
243 aa  62  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  26.54 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  25.31 
 
 
243 aa  58.5  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1887  protein of unknown function DUF881  22.98 
 
 
388 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.201634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0147  protein of unknown function DUF881  31.41 
 
 
236 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1076  hypothetical protein  27.47 
 
 
237 aa  56.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  19.92 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  19.92 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  19.92 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2728  protein of unknown function DUF881  22.33 
 
 
309 aa  55.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  23.98 
 
 
234 aa  55.5  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1735  protein of unknown function DUF881  24.86 
 
 
290 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.980276  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18230  hypothetical protein  26.67 
 
 
288 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509539  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4999  hypothetical protein  22.63 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  19.58 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2283  hypothetical protein  24.4 
 
 
249 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0076216  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  22.54 
 
 
250 aa  52.4  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  19.83 
 
 
292 aa  52  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2105  protein of unknown function DUF881  25.83 
 
 
273 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  26.96 
 
 
301 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3098  protein of unknown function DUF881  21.26 
 
 
258 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1464  hypothetical protein  32.39 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.420029  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  27.86 
 
 
306 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5001  hypothetical protein  23.17 
 
 
297 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2103  protein of unknown function DUF881  24.73 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11853  hypothetical protein  23.84 
 
 
307 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  22.33 
 
 
315 aa  48.9  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0021  protein of unknown function DUF881  21.99 
 
 
280 aa  48.5  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0476  hypothetical protein  25 
 
 
325 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.75906  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  21.3 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  19.42 
 
 
255 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0167  protein of unknown function DUF881  22.58 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.942049  normal  0.647694 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0799  hypothetical protein  20.66 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1228  hypothetical protein  22.64 
 
 
271 aa  45.8  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.861927  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18250  hypothetical protein  24.74 
 
 
436 aa  45.8  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  21.99 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2730  protein of unknown function DUF881  22.39 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242021  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3139  hypothetical protein  25.17 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3404  hypothetical protein  19.81 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227023  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2384  hypothetical protein  20.1 
 
 
305 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3137  hypothetical protein  19.65 
 
 
254 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428458  normal  0.0440298 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1025  protein of unknown function DUF881  23.71 
 
 
239 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0132  hypothetical protein  30.38 
 
 
296 aa  41.6  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0808473  normal  0.140959 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>