57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14990 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14990  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  479  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  0.621189 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0474  hypothetical protein  32.76 
 
 
273 aa  120  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.166474  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2384  hypothetical protein  40.19 
 
 
305 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1737  protein of unknown function DUF881  35.71 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.588526  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2522  hypothetical protein  40.64 
 
 
309 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4999  hypothetical protein  39.22 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15510  hypothetical protein  40.32 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3126  protein of unknown function DUF881  40.45 
 
 
571 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  38.73 
 
 
255 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18250  hypothetical protein  35.16 
 
 
436 aa  108  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2728  protein of unknown function DUF881  38.57 
 
 
309 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1303  protein of unknown function DUF881  37.7 
 
 
333 aa  105  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.412447  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0799  hypothetical protein  33.6 
 
 
278 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2103  protein of unknown function DUF881  36.27 
 
 
246 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1228  hypothetical protein  33.94 
 
 
271 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.861927  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3098  protein of unknown function DUF881  43.58 
 
 
258 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  34.96 
 
 
292 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1887  protein of unknown function DUF881  32.88 
 
 
388 aa  92.8  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.201634 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1466  hypothetical protein  39.46 
 
 
296 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  35.05 
 
 
270 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  35.05 
 
 
270 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  35.05 
 
 
270 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3137  hypothetical protein  34.69 
 
 
254 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428458  normal  0.0440298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3404  hypothetical protein  34.95 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227023  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2715  hypothetical protein  40.48 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0632611  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  33.33 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  30.92 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  24.64 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  31.05 
 
 
234 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  22.5 
 
 
235 aa  62  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0021  hypothetical protein  31.51 
 
 
273 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  35 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  27.35 
 
 
234 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  24.89 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  27.69 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  26.13 
 
 
240 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  31.3 
 
 
243 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  26.34 
 
 
234 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2282  hypothetical protein  32.63 
 
 
235 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0713183  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  28.38 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  29.93 
 
 
233 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  29.33 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  31.58 
 
 
315 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  31.75 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  29.7 
 
 
230 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0072  protein of unknown function DUF881  28.05 
 
 
242 aa  49.3  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  25.24 
 
 
253 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  22.67 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  30.72 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  22.41 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  26.47 
 
 
278 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  26.47 
 
 
278 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  36.79 
 
 
306 aa  45.4  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  26.47 
 
 
278 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  23.3 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0148  protein of unknown function DUF881  31.65 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  22.55 
 
 
239 aa  42  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>