221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0398 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  100 
 
 
389 aa  782  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  73.45 
 
 
391 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  67.12 
 
 
375 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.18402e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  63.1 
 
 
376 aa  492  1e-138  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  61.97 
 
 
376 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  55.08 
 
 
393 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  51.41 
 
 
393 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  49.33 
 
 
375 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  43.16 
 
 
375 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  43.16 
 
 
375 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  45.04 
 
 
374 aa  348  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  45.7 
 
 
374 aa  330  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  44.36 
 
 
713 aa  315  1e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  44.71 
 
 
738 aa  312  8e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4012  putative RNA methylase  45.08 
 
 
387 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  41.67 
 
 
399 aa  295  7e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01161  RNA methylase family protein  38.65 
 
 
374 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03361  RNA methylase family protein  40.97 
 
 
374 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  43.92 
 
 
705 aa  290  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.63 
 
 
708 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  42.05 
 
 
380 aa  287  2e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1415  putative RNA methylase  38.65 
 
 
374 aa  286  3e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.941781  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0412  putative RNA methylase  46.7 
 
 
382 aa  286  3e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4128  putative RNA methylase  44.82 
 
 
387 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4154  putative RNA methylase  44.56 
 
 
387 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.84 
 
 
749 aa  285  1e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2064  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.71 
 
 
705 aa  283  3e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08561  putative N6-adenine-specific DNA methylase  40.27 
 
 
381 aa  281  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2090  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.11 
 
 
725 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1362  hypothetical protein  39.78 
 
 
484 aa  280  3e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.36 
 
 
713 aa  279  8e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.36 
 
 
711 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.91 
 
 
706 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1649  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.59 
 
 
705 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.1 
 
 
713 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  38.08 
 
 
387 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.59 
 
 
706 aa  277  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.03 
 
 
711 aa  276  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.59 
 
 
706 aa  277  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.36 
 
 
709 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.36 
 
 
709 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.36 
 
 
709 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  42.59 
 
 
706 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.1 
 
 
713 aa  277  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2250  putative RNA methylase  42.09 
 
 
380 aa  276  5e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.959304  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.36 
 
 
709 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.68014e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.17 
 
 
712 aa  276  6e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1615  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.63 
 
 
730 aa  275  1e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  5.68261e-05 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1488  hypothetical protein  37.89 
 
 
393 aa  275  1e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00216876  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.83 
 
 
709 aa  274  2e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00591  RNA methylase family protein  39.19 
 
 
374 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3255  RNA methylase family protein  35.88 
 
 
392 aa  273  4e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710684  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1680  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.48 
 
 
707 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.719337  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2096  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.11 
 
 
730 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.110427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3643  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.11 
 
 
730 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.698608 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1551  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.05 
 
 
718 aa  269  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.728211  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1608  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.11 
 
 
730 aa  269  6e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.46 
 
 
721 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  38.98 
 
 
387 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0196  putative RNA methylase  38.06 
 
 
395 aa  267  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.289998 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  41.78 
 
 
398 aa  267  3e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  39.25 
 
 
388 aa  266  4e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18930  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.07 
 
 
738 aa  266  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1123  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.21 
 
 
702 aa  265  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.482785  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0074  putative RNA methylase  40.47 
 
 
376 aa  265  8e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1170  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.21 
 
 
702 aa  265  9e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.988002  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1102  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.21 
 
 
702 aa  265  9e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.597986 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1136  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.21 
 
 
702 aa  265  9e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237115  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1019  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.21 
 
 
702 aa  265  9e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.63679e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3009  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.95 
 
 
725 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30746  hitchhiker  1.88031e-11 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00768  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.73 
 
 
711 aa  264  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192916  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.23 
 
 
711 aa  263  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.01 
 
 
702 aa  262  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1112  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  40.74 
 
 
702 aa  262  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000933928  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.44 
 
 
711 aa  262  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1063  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.01 
 
 
702 aa  262  9e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  3.72198e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00959  hypothetical protein  41.01 
 
 
702 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1057  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.01 
 
 
702 aa  262  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.81203e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2695  putative RNA methylase  41.01 
 
 
702 aa  262  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0489936  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00952  predicted methyltransferase  41.01 
 
 
702 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000729792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2648  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.01 
 
 
702 aa  262  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0833868  hitchhiker  0.000556962 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2171  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.01 
 
 
702 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.66949e-05  normal  0.466381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  36.39 
 
 
385 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1460  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.27 
 
 
702 aa  260  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.372421  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2311  methylase, putative  38.99 
 
 
762 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9895  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  36.86 
 
 
377 aa  259  8e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2108  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.99 
 
 
750 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.949067  decreased coverage  0.00266929 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2256  N6-adenine-specific DNA methylase  41.35 
 
 
369 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00159755  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0054  putative RNA methylase  35.6 
 
 
374 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.83 
 
 
715 aa  257  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.19 
 
 
711 aa  257  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1322  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  41.8 
 
 
712 aa  257  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0919587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1788  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.2 
 
 
756 aa  255  1e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0401  putative RNA methylase  36.83 
 
 
387 aa  254  2e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1699  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.43 
 
 
722 aa  253  5e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  38.38 
 
 
380 aa  252  9e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00641  RNA methylase family protein  35.87 
 
 
374 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2717  putative RNA methylase  36.36 
 
 
398 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2828  putative RNA methylase:THUMP  37.04 
 
 
417 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.5 
 
 
708 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>