194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3050 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 
137 aa  275  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  50.37 
 
 
134 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  50.37 
 
 
134 aa  141  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1974  hemerythrin-like metal-binding protein  47.33 
 
 
147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.579152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  47.37 
 
 
138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  48.18 
 
 
138 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  47.73 
 
 
131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  40.91 
 
 
132 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  44.62 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  41.67 
 
 
138 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  44.09 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  41.61 
 
 
138 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  36.72 
 
 
140 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  37.5 
 
 
137 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  37.31 
 
 
146 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  37.31 
 
 
144 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  40.74 
 
 
133 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  35.82 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  39.26 
 
 
133 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  39.26 
 
 
133 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  32.59 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  90.5  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  37.96 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  36.5 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0482325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  36.09 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  36.36 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  35.61 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2307  hemerythrin-like metal-binding protein  33.58 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  29.63 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  34.09 
 
 
133 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  34.09 
 
 
133 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.84 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  34.33 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  32.84 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.09 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  34.59 
 
 
132 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  33.59 
 
 
144 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  30.71 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  31.34 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  33.08 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  31.34 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  32.79 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  32.35 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.03 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.36 
 
 
518 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  31.62 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  32.81 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  31.5 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2262  hemerythrin-like metal-binding protein  28.68 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119612  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.1 
 
 
515 aa  72  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.36 
 
 
515 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  29.85 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.83 
 
 
994 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.1 
 
 
518 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  27.42 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  30.47 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  33.59 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.03 
 
 
941 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0618  hemerythrin-like metal-binding protein  31.62 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.8405  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  28.36 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  30.15 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0253  hemerythrin  32.09 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882581  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.08 
 
 
526 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  30.6 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.67 
 
 
1032 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  29.55 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0327  hemerythrin-like metal-binding protein  28.15 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.24 
 
 
722 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2752  hemerythrin-like metal-binding protein  29.55 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.976413  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  27.14 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1451  hemerythrin-like, metal-binding  32.58 
 
 
277 aa  64.3  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2564  hemerythrin-like metal-binding protein  28.03 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.059586  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  27.69 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2568  hemerythrin-like metal-binding protein  28.03 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00123244  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.77 
 
 
779 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  28.03 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.32 
 
 
689 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  30.47 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  27.07 
 
 
529 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  26.28 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.55 
 
 
559 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.07 
 
 
529 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  32.14 
 
 
142 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  30.97 
 
 
722 aa  61.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.07 
 
 
529 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  33.05 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  28.91 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1333  hemerythrin HHE cation binding region  28.57 
 
 
161 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000254563 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  30.37 
 
 
131 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  30.6 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.15 
 
 
529 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  25.56 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.61 
 
 
529 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.15 
 
 
529 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.15 
 
 
529 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.15 
 
 
529 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  30.08 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  34.92 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  30.66 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>