178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0861 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  100 
 
 
194 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  80.41 
 
 
194 aa  345  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  80.41 
 
 
194 aa  344  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  81.35 
 
 
216 aa  344  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  79.89 
 
 
192 aa  338  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  79.89 
 
 
192 aa  338  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  81.77 
 
 
182 aa  329  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.78 
 
 
189 aa  160  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.6 
 
 
190 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  40.46 
 
 
211 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  38.33 
 
 
193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  40.12 
 
 
187 aa  141  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1335  heterodisulfide reductase, C subunit  38.82 
 
 
177 aa  140  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.14 
 
 
502 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  35.56 
 
 
204 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0848  heterodisulfide reductase, C subunit  35.68 
 
 
202 aa  136  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  33.72 
 
 
188 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  36.41 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  35.87 
 
 
213 aa  132  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3524  heterodisulfide reductase, C subunit  38.2 
 
 
185 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  36.16 
 
 
186 aa  131  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  38.89 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1348  heterodisulfide reductase, C subunit  31.58 
 
 
192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.511519 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.95 
 
 
497 aa  128  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  35.03 
 
 
186 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  36.47 
 
 
508 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1806  heterodisulfide reductase, C subunit  36.16 
 
 
189 aa  125  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  34.64 
 
 
502 aa  124  9e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  32.78 
 
 
502 aa  124  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17750  hypothetical protein  34.34 
 
 
204 aa  123  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  34.1 
 
 
184 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1574  putative heterodisulfide reductase, C subunit  30.54 
 
 
174 aa  100  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0975  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  39.83 
 
 
133 aa  99.4  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.826747  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1700  putative heterodisulfide reductase, C subunit  32.73 
 
 
193 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000309238 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4092  heterodisulfide reductase subunit C-like  36.46 
 
 
148 aa  90.9  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0417  putative heterodisulfide reductase, C subunit  30.67 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.344766 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3574  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  28.34 
 
 
202 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  25.99 
 
 
195 aa  87  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0820  putative heterodisulfide reductase, C subunit  30.25 
 
 
192 aa  86.3  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1252  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  42.11 
 
 
160 aa  84.7  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  29.71 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1882  heterodisulfide reductase subunit C  25.29 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1646  heterodisulfide reductase subunit C  27.47 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2663  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  35.44 
 
 
129 aa  79  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0439  heterodisulfide reductase subunit C-like  41.03 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0633  putative heterodisulfide reductase, C subunit  27.57 
 
 
200 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1161  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.23 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.860285  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2103  heterodisulfide reductase subunit C (HdrC-2)  28.82 
 
 
230 aa  72  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.666222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.23 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1543  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  28.07 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2212  heterodisulfide reductase subunit C  30.71 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0191178  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1697  hypothetical protein  40 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000729724 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2133  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  30.77 
 
 
384 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2896  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  29.67 
 
 
384 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.217971 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.71 
 
 
382 aa  65.1  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0184362  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1113  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  29.03 
 
 
384 aa  64.7  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0397617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  37.97 
 
 
412 aa  64.7  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0636  iron-sulfur cluster-binding protein  30.6 
 
 
238 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.126769 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0239  hypothetical protein  26.55 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.577493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1953  heterodisulfide reductase subunit HdrC  29.55 
 
 
236 aa  62  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0625  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.67 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0590  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.57 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.321199  normal  0.0726 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0035  heterodisulfide reductase, putative  29.9 
 
 
393 aa  61.6  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000417872  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2241  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit C  28.57 
 
 
194 aa  61.6  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0469153  normal  0.0166067 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1078  heterodisulfide reductase subunit C  27.89 
 
 
253 aa  61.2  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.114051  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1604  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  34.21 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.455044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3201  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  27.47 
 
 
408 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0539  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  34.21 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1547  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  32.47 
 
 
280 aa  60.8  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0377  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.21 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.21 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2099  heterodisulfide reductase, subunit C (HdrC-1)  31.17 
 
 
280 aa  60.5  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2216  hypothetical protein  30.3 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.278188  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0632  iron-sulfur cluster-binding protein  30.3 
 
 
230 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0958053 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31.65 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.802269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1001  heterodisulfide reductase, putative  27.78 
 
 
398 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.284636  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  25.27 
 
 
407 aa  59.7  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1582  heterodisulfide reductase, putative  28.89 
 
 
392 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00374998  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.81 
 
 
437 aa  58.9  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1836  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.03 
 
 
191 aa  58.2  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139025  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2555  iron-sulfur cluster-binding protein  35.14 
 
 
228 aa  58.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2185  hypothetical protein  35.14 
 
 
228 aa  58.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  hitchhiker  0.00000000457726 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2551  iron-sulfur cluster-binding protein  26.77 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802978  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2341  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.67 
 
 
439 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1436  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  32.91 
 
 
533 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.695739  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0402  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.57 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0280446  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2125  heterodisulfide reductase, transmembrane subunit, putative  29.21 
 
 
393 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1834  heterodisulfide reductase, putative  27.78 
 
 
391 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0759481  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  28.57 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.507445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0142  hypothetical protein  33.33 
 
 
418 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0093  hypothetical protein  32.43 
 
 
423 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  27.47 
 
 
387 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.38 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1282  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.57 
 
 
416 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.438227 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.67 
 
 
383 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.67 
 
 
383 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0474  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.561183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3961  DNA binding domain-containing protein  29.58 
 
 
314 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3531  DNA binding domain-containing protein  29.58 
 
 
308 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635038  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>