68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4723 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4723  protein of unknown function DUF1130  100 
 
 		 157 aa  312  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264076  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0922  hypothetical protein  85.71 
 
 		 155 aa  268  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2775  hypothetical protein  44.36 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.278362  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4240  hypothetical protein  46.21 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0072533  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  44.67 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0251  hypothetical protein  44.62 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.726286  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5300  hypothetical protein  39.13 
 
 		 166 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118609 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  39.1 
 
 		 167 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1798  hypothetical protein  38.3 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1898  hypothetical protein  40.91 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0934802  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1162  hypothetical protein  32.14 
 
 		 284 aa  87.8  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2617  protein of unknown function DUF1130  42.25 
 
 		 146 aa  87.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.727406  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  37.59 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  40.69 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3912  hypothetical protein  41.46 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4268  protein of unknown function DUF1130  43.51 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5517  hypothetical protein  41.98 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  38.93 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4371  protein of unknown function DUF1130  43.18 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.201417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3900  hypothetical protein  41.98 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.900559  normal  0.203782 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2197  hypothetical protein  35.43 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5361  hypothetical protein  41.67 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0304  hypothetical protein  35.71 
 
 		 297 aa  73.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  normal  0.186853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0773  protein of unknown function DUF1130  34.53 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6081  protein of unknown function DUF1130  43.94 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  33.59 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  30 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0516  hypothetical protein  37.98 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597563  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  27.63 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  34.78 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  34.78 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0956  hypothetical protein  29.2 
 
 		 198 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  27.89 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0457  hypothetical protein  32.41 
 
 		 351 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  28.48 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  30.43 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4520  hypothetical protein  28.79 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3526  hypothetical protein  30.67 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0793  hypothetical protein  30.43 
 
 		 198 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0033  protein of unknown function DUF1130  32.45 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  28.79 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  29.71 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1153  protein of unknown function DUF1130  31.65 
 
 		 195 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.908122 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0015  hypothetical protein  31.79 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4854  hypothetical protein  28.68 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.0401842 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  32.12 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4337  hypothetical protein  28.68 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0844376  hitchhiker  0.00670192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2774  hypothetical protein  29.45 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670042  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  30.22 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0796  protein of unknown function DUF1130  30.22 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30420  hypothetical protein  26.95 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.711369  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3400  hypothetical protein  32.89 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000709741  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3471  hypothetical protein  31.76 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.646682  normal  0.0531544 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  25 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3417  hypothetical protein  27.74 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0955  hypothetical protein  26.71 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.947235 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  27.45 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0758  hypothetical protein  27.97 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.223342  normal  0.212475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4695  protein of unknown function DUF1130  29.93 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0878626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1029  hypothetical protein  28.68 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14565  normal  0.606102 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1081  hypothetical protein  26.23 
 
 		 148 aa  43.9  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2843  hypothetical protein  25.16 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000164273  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4905  hypothetical protein  29.29 
 
 		 194 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.556359  normal  0.961888 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1743  protein of unknown function DUF1130  24.83 
 
 		 144 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3461  hypothetical protein  29.29 
 
 		 194 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  24 
 
 		 199 aa  42  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000271396  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5381  hypothetical protein  29.29 
 
 		 194 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782244  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0743  hypothetical protein  34.45 
 
 		 319 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>