More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4573 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  100 
 
 		 159 aa  322  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  66.67 
 
 		 150 aa  194  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  63.19 
 
 		 155 aa  191  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  63.89 
 
 		 161 aa  190  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  61.7 
 
 		 142 aa  189  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  64.44 
 
 		 153 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  66.67 
 
 		 150 aa  187  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  64.66 
 
 		 162 aa  187  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  65.93 
 
 		 154 aa  187  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2399  ribonuclease H  62.77 
 
 		 157 aa  186  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  64.03 
 
 		 146 aa  186  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  59.59 
 
 		 150 aa  186  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  61.43 
 
 		 154 aa  184  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  57.23 
 
 		 164 aa  184  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  58.78 
 
 		 151 aa  184  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  61.43 
 
 		 151 aa  184  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1836  ribonuclease H  68.38 
 
 		 151 aa  183  9e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4730  ribonuclease H  62.42 
 
 		 154 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  60.42 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  60.42 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4350  ribonuclease H  61.74 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4436  ribonuclease H  61.74 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285244  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  66.17 
 
 		 151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  62.77 
 
 		 154 aa  181  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  62.96 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  62.04 
 
 		 154 aa  180  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1662  Ribonuclease H  65.44 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  59.74 
 
 		 170 aa  179  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  62.96 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1826  ribonuclease H  62.04 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  60 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  58.74 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  58.74 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  58.74 
 
 		 146 aa  178  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  58.74 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  60.71 
 
 		 145 aa  179  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  58.74 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  58.74 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  62.41 
 
 		 153 aa  178  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  64.66 
 
 		 151 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  58.74 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  63.91 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  62.14 
 
 		 147 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  59.29 
 
 		 150 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  62.77 
 
 		 155 aa  177  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  59.31 
 
 		 154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  62.77 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  62.77 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  62.77 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  62.77 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  62.77 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  62.77 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  62.77 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  59.57 
 
 		 149 aa  177  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  62.77 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  57.34 
 
 		 148 aa  177  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  59.57 
 
 		 147 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  60.26 
 
 		 166 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  58.87 
 
 		 147 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  58.87 
 
 		 147 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  58.87 
 
 		 147 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  63.91 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  56.95 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  61.31 
 
 		 155 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  58.57 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  60.58 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  62.77 
 
 		 155 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  60.58 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  60.58 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2340  ribonuclease H  63.7 
 
 		 149 aa  175  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  59.03 
 
 		 154 aa  174  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  59.85 
 
 		 156 aa  175  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  57.34 
 
 		 148 aa  174  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  61.31 
 
 		 154 aa  174  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1258  ribonuclease H  59.73 
 
 		 153 aa  174  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  58.16 
 
 		 147 aa  174  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1334  ribonuclease H  54.61 
 
 		 143 aa  174  6e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  59.29 
 
 		 157 aa  174  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  58.16 
 
 		 147 aa  174  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  62.04 
 
 		 143 aa  173  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  61.31 
 
 		 154 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  60.58 
 
 		 154 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  61.31 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0424  ribonuclease H  54.48 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456208  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1616  ribonuclease H  56.85 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000113365  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  61.31 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  60 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  61.31 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  61.31 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  61.31 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1763  ribonuclease H  54.48 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4905  ribonuclease H  64.23 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  59.7 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1338  ribonuclease H  53.9 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  58.57 
 
 		 148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  59.12 
 
 		 147 aa  171  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  58.39 
 
 		 153 aa  171  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02469  ribonuclease H  58.39 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.79431  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  57.05 
 
 		 155 aa  170  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  58.7 
 
 		 156 aa  170  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>