More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3150 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  100 
 
 		 137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  60.48 
 
 		 130 aa  164  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  61.29 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  61.29 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  61.29 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  62.88 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  61.29 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  58.27 
 
 		 131 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  58.39 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  55.88 
 
 		 167 aa  155  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  61.67 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  56.1 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  55.47 
 
 		 138 aa  148  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  57.26 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  55.22 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  55.12 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7037  ferric uptake regulator, Fur family  59.5 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  52.17 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  57.26 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  54.03 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  52.76 
 
 		 142 aa  143  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13650  zinc uptake regulator, Fur family  59.32 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2085  zinc uptake regulator  53.97 
 
 		 138 aa  141  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1772  ferric uptake regulator, Fur family  52.85 
 
 		 141 aa  140  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.431388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  52.55 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3230  ferric uptake regulator, Fur family  54.89 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0854036  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  52.76 
 
 		 133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0734  ferric uptake regulator, Fur family  56.1 
 
 		 123 aa  137  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  55.74 
 
 		 135 aa  136  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07800  zinc uptake regulator, Fur family  53.24 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  54.03 
 
 		 187 aa  134  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  54.1 
 
 		 142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  48.82 
 
 		 129 aa  130  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  53.23 
 
 		 150 aa  130  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  51.67 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2442  ferric uptake regulator, Fur family  44.19 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168746 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0885  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  49.6 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  44 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  41.73 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  42.4 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  39.2 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  37.8 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  38.89 
 
 		 146 aa  100  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  39.2 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  36.22 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  36.09 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  35.16 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  34.92 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  29.46 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  30.16 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  32.81 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  30.71 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  36.29 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11241  ferric uptake regulator family protein  39.06 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  29.01 
 
 		 155 aa  84.3  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  29.17 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2248  ferric uptake regulator, Fur family  38.33 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  27.13 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  28.35 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2859  ferric-uptake regulator  35.43 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.141734 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  28.35 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  36.51 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  28.35 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  28.24 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  31.75 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1033  ferric uptake regulator family  36.3 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  35 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0817  ferric uptake regulator family protein  37.4 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11321  ferric uptake regulator family protein  37.21 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.948862  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  34.96 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1041  ferric uptake regulator family protein  36.15 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.213524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  30.4 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1661  ferric uptake regulator  36.07 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000966153  normal  0.373988 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  30.95 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  35.25 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  31.75 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11321  ferric uptake regulator family protein  36.43 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  30.71 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  31.01 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  29.92 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4413  ferric uptake regulator, Fur family  37.3 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00116957  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3031  ferric uptake regulator family protein  34.17 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19031  ferric uptake regulator family protein  36.84 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.442263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1892  Fur family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  31.2 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  27.13 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0466  ferric uptake regulator family protein  33.61 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  33.61 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2913  ferric uptake regulator family protein  33.9 
 
 		 142 aa  76.6  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0360  ferric uptake regulation protein  35 
 
 		 138 aa  76.6  0.00000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08960  ferric uptake regulator, Fur family  33.33 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  28.68 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>